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Transposable elements in yeasts - 03/08/11

Doi : 10.1016/j.crvi.2011.05.017 
Claudine Bleykasten-Grosshans a, , Cécile Neuvéglise b, c
a CNRS UMR 7156, laboratoire génétique moléculaire génomique microbiologie, université de Strasbourg, 28, rue Goethe, 67083 Strasbourg cedex, France 
b Micalis UMR 1319, Inra, biologie intégrative du métabolisme lipidique microbien, bâtiment CBAI, 78850 Thiverval-Grignon, France 
c AgroParisTech, 78850 Thiverval-Grignon, France 

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Abstract

With the development of new sequencing technologies in the past decade, yeast genomes have been extensively sequenced and their structures investigated. Transposable elements (TEs) are ubiquitous in eukaryotes and constitute a limited part of yeast genomes. However, due to their ability to move in genomes and generate dispersed repeated sequences, they contribute to modeling yeast genomes and thereby induce plasticity. This review assesses the TE contents of yeast genomes investigated so far. Their diversity and abundance at the inter- and intraspecific levels are presented, and their effects on gene expression and genome stability is considered. Recent results concerning TE–host interactions are also analyzed.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

Grâce au développement des nouvelles technologies de séquençage, ces dix dernières années, de nombreux génomes de levures ont été séquencés et leurs structures examinées. Les éléments transposables, qui sont ubiquitaires chez les eucaryotes, représentent une faible proportion des génomes de levure. Cependant, grâce à leur capacité à se déplacer dans les génomes et à générer des séquences répétées dispersées, leur rôle dans la structure et la plasticité des génomes de levures est démontrée. Cet article de synthèse décrit les transposons des génomes de levure actuellement étudiés. Leur diversité et leur abondance au niveau inter- et intra-espèce sont présentées, ainsi que leur impact sur l’expression des gènes et la stabilité des génomes. Les résultats les plus récents sur les interactions hôte–élément transposable sont également discutés.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Transposition, LTR retrotransposon, LINE, Genome, Genetic diversity, Evolution, Repeated sequences

Mots clés : Transposition, Rétrotransposon à LTR, LINE, Génome, Diversité génétique, Évolution, Séquences répétées


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Vol 334 - N° 8-9

P. 679-686 - août 2011 Retour au numéro
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