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Enhancement of the in vitro transcription by T7 RNA polymerase of short DNA templates containing oxidative thymine lesions - 01/01/05

Doi : 10.1016/j.crvi.2005.07.003 
Valérie Guerniou, Didier Gasparutto, Thierry Douki, Jean Cadet, Sylvie Sauvaigo
Laboratoire « Lésions des acides nucléiques », Service de chimie inorganique et biologique, FRE 2600, CEA/DSM/Département de recherche fondamentale sur la matière condensée, CEA-Grenoble, 17, rue des Martyrs, 38054 Grenoble cedex 9, France 

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Abstract

5-(Hydroxymethyl)uracil, 5-formyluracil or 5-carboxyuracil can be formed in DNA upon exposure to ionizing radiations. We report the effect of the latter oxidative lesions on the in vitro transcription by T7 RNA polymerase using a single-stranded short model template. Kinetic experiments showed that the transcription yield was increased with the modified template. Due to the unforeseen presence of a hairpin structure within the transcribed RNA, we postulated that we are in the presence of a T7 RNA polymerase pausing signal and that the lesions within this critical DNA structure could interfere with normal regulation of RNA transcription. To cite this article: V. Guerniou et al., C. R. Biologies 328 (2005).

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

La 5-(hydroxyméthyl)uracile, la 5-formyluracile et la 5-carboxyuracile sont formées lors de lʼexposition de lʼADN aux rayonnements ionisants. Nous reportons lʼeffet de ces dommages oxydatifs sur la transcription in vitro par la T7 ARN polymérase dʼune matrice courte simple brin. Les expériences cinétiques montrent que le rendement de transcription est plus élevé en présence des bases modifiées. Notre hypothèse est que les bases modifiées, localisées dans une structure en épingle à cheveu sur la matrice, modifient un signal de pause de lʼenzyme et interfèrent avec la régulation normale de la transcription dʼARN. Pour citer cet article : V. Guerniou et al., C. R. Biologies 328 (2005).

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Oxidative DNA damage, 5-(Hydroxymethyl)uracil, 5-Formyluracil, 5-Carboxyuracil, T7 RNA polymerase, In vitro transcription, Pausing signal

Mots-clés : Dommages oxydatifs de lʼADN, 5-(Hydroxyméthyl)uracile, 5-Formyluracile, 5-Carboxyuracile, T7 ARN polymérase, Transcription in vitro, Signal de pause


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Vol 328 - N° 9

P. 794-801 - septembre 2005 Retour au numéro
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