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Isolation and molecular identification of actinomycete microflora, of some saharian soils of south east Algeria (Biskra, EL-Oued and Ourgla) study of antifungal activity of isolated strains - 01/01/05

Doi : 10.1016/j.mycmed.2004.12.004 
A. Boudemagh a, b, , M. Kitouni a, b, F. Boughachiche a, H. Hamdiken a, L. Oulmi a, S. Reghioua a, H. Zerizer a, A. Couble b, D. Mouniee b, A. Boulahrouf a, P. Boiron b
a Laboratoire de Microbiologie Appliquée, Département des Sciences de la Nature et de la Vie, Université Mentouri, Constantine, Algeria 
b UMR CNRS 5557, Ecologie Microbienne (Center for Microbial Ecology), Groupe de Recherche « Pathogènes opportunistes et environnement », Laboratoire de Mycologie Fondamentale et Appliquée aux Biotechnologies Industrielles, Faculté de Pharmacie, Université Claude Bernard Lyon 1, 8, avenue Rockefeller, 69373 Lyon cedex 8, France 

*Corresponding author.

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Abstract

As part of a research program whose aim is to identify new antifungal metabolites from rare actinomycetes, three Saharan soils from south east Algeria were analyzed. Twenty-seven (27) strains of actinomycetes were isolated and tested for their antifungal activity. The soil from the region of Biskra gave the highest number of actinomycetes, i.e. 52% versus 18% and 30% for the soils from El-Oued and Ourgla, respectively. The results of this study showed the GLM medium to be the most favorable for the isolation of actinomycetes from these ecosystems, on its own providing 17 strains out of the total number of actinomycetes isolated. Two strains presented very important antifungal activity against most of the filamentous fungi and test yeasts used. Molecular identification by polymerase chain reaction using universal 16S rDNA primers allowed the two active strains to be classified in the genus Streptomyces.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

Lors d'un programme de recherche de nouveaux métabolites antifongiques à partir des actinomycètes rares, trois sols sahariens du sud-est algérien ont été explorés. Vingt-sept (27) souches d'actinomycètes ont été isolées et testées pour leurs activités antifongiques. Le sol de la région de Biskra a donné le plus grand nombre d'actinomycètes soit 52 contre 18 et 30 % des sols d'El-Oued et de Ourgla. D'après cette étude, le milieu GLM est le plus favorable pour l'isolement des actinomycètes à partir de ces écosystèmes, il offre à lui seul 17 souches sur le total des actinomycètes isolés. Deux souches présentent une activité antifongique très importante contre la plupart des champignons filamenteux et levures tests utilisés. L'identification moléculaire par réaction de polymérase en chaîne (PCR), en utilisant des amorces universelles de l'ADNr 16S à permit de classer les deux souches actives dans le genre Streptomyces.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Antifungal activity, Actinomycete, Saharian soils, Molecular identification, Universel primer

Mots clés : Activité antifongique, Actinomycète, Sol du Sahara, Identification moléculaire, Amorce universelle


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Vol 15 - N° 1

P. 39-44 - mars 2005 Retour au numéro
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  • Screening of antimicrobial activity of marine sponge extracts
  • S. Rifai, A. Fassouane, A. El-Abbouyi, A. Wardani, A. Kijjoa, R. Van Soest
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  • Isolation of actinomycetes producing bioactive substances from water, soil and tree bark samples of the north-east of Algeria
  • M. Kitouni, A. Boudemagh, L. Oulmi, S. Reghioua, F. Boughachiche, H. Zerizer, H. Hamdiken, A. Couble, D. Mouniee, A. Boulahrouf, P. Boiron

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