De l'approche différentielle pour l'identification de marqueurs à l'analyse fonctionnelle pour la mise en évidence de cibles thérapeutiques, la protéomique apporte de nouvelles données fondamentales pour la compréhension des mécanismes de la cancérogenèse et des perspectives pour la clinique. Néanmoins la protéomique, comme l'ensemble des approches de post-génomique, doit faire face à la complexité cellulaire et moléculaire des systèmes biologiques ; le cas du cancer du sein illustre bien cette situation.

From differential analysis for the identification of biomarkers, to functional analysis for the evidencing of new therapeutic targets, proteomics brings new comprehensive information for a better understanding of the molecular basis of oncology and new perspectives for the clinic. However the major limitation of proteomic investigations and more generally of post-genomic approaches remains the molecular and cellular complexity of biological systems. This will be illustrated with the case of breast cancer.