Le régime sans gluten demeure le seul traitement de la maladie coeliaque. Il implique l'exclusion de l'alimentation des produits à base de farine de blé, d'orge, de seigle. Les progrès des connaissances concernant la maladie coeliaque en ont modifié les contours : actuellement, la forme symptomatique n'est considérée que comme la partie émergée d'un iceberg comprenant aussi des formes silencieuses (atrophie villositaire isolée) six à huit fois plus fréquentes que la forme symptomatique et des formes latentes (muqueuse intestinale normale). Cette nouvelle vision conduit chez l'enfant à discuter les indications du régime en fonction de la forme de la maladie. Si le régime est en effet très efficace, il reste contraignant malgré les efforts de l'Association française des intolérants au gluten (AFDIAG) pour en faciliter l'observance.