Les infections fongiques ont pris une part importante au sein des infections nosocomiales. Le diagnostic de certitude ces infections nécessite l'aide du laboratoire. Des progrès significatifs ont été enregistrés ces dernières années dans le domaine du diagnostic direct (examen direct plus sensible, milieux d'identification chromogéniques). Les hémocultures peuvent avoir une sensibilité accrue grâce à l'utilisation de milieux « fongiques ». En revanche, le diagnostic indirect reste peu performant, même si quelques avancées suggèrent l'intérêt d'une détection simultanée d'antigènes circulants et des anticorps dirigés contre ces mêmes antigènes. L'avenir pourrait bénéficier de l'apport des méthodes de biologie moléculaire aussi bien dans le domaine du diagnostic d'infection (détection d'ADN fongique dans le sérum) que dans celui de l'identification des espèces. Enfin, la surveillance et l'étude de l'écologie fongique des services cliniques, avec l'apport du typage moléculaire, devraient permettre une meilleure compréhension de la physiopathologie de ces infections et une anticipation des phénomènes épidémiques.

Fungal infections account for an increasing fraction of nosocomial infections. The laboratory is essential to ascertain the diagnosis. Significant progress has been recently achieved in direct diagnostic tools (better sensitivity of direct examination, development of chromogenic identification media). Diagnostic sensitivity of blood cultures can be increased with the use of special fungal media for cuture. However, indirect diagnostic methods remain unsatisfactory, even though some new data support the usefulness of simultaneous detection of circulating antigens and corresponding antibodies. In the future, the contribution of molecular biology techniques could be of great interest, either in the diagnostic (detection of fungal DNA in the serum) or in the identification of species. Last but not least, molecular typing allows a precise monitoring of fungal ecology that could prove useful to the understanding of the physiopathology of infections and to the anticipation and prevention of epidemic outbreaks.