Toute pathologie infectieuse correspond à une agression par un agent pathogène, dit parasite. Les manifestations cliniques résultent d'un déséquilibre entre la virulence de l'agent pathogène et les défenses immunitaires de l'hôte<sup>[1Casadevall A., Pirofski L. Host-pathogen interactions: the attributes of virulence J. Infect. Dis. 2001 ;  184 : 337-344 [cross-ref]

Cliquez ici pour aller à la section Références]</sup>. Notre environnement est peuplé d'une multitude de micro-organismes, virus, bactéries, parasites ou champignons, qui, lors de leur rencontre avec l'hôte, chercheront à survivre et à se multiplier mais seuls certains développeront un pouvoir pathogène. L'hôte réagit par la mise en place des différents moyens de défense qui agissent de façon conjointe et synergique, d'abord non spécifique (immunité innée) puis spécifique (immunité adaptative). La réponse immunitaire est de cette manière adaptée à chaque type d'infection et de micro-organisme. L'interaction hôte-parasite est donc un processus dynamique au cours duquel chaque protagoniste agit pour augmenter ses chances de survie, ce qui aboutit schématiquement à trois situations : porteur sain, porteur asymptomatique ou expression clinique d'une maladie. Par ailleurs, certains facteurs peuvent modifier la relation hôte-parasite, soit au profit du micro-organisme (déficits immunitaires), soit au profit de l'hôte (vaccination, thérapie anti-infectieuse), mais une guérison complète n'est le plus souvent possible que grâce à l'existence des défenses immunitaires de l'hôte. Ainsi, la relation hôte-parasite régit l'ensemble de la pathologie infectieuse et sa compréhension est nécessaire à la prise en charge des problèmes d'infectiologie.