Les mycobactéries atypiques ou non tuberculeuses sont des bactéries de l'environnement responsables d'infections opportunistes rares. Le diagnostic de ces infections au laboratoire repose sur les mêmes techniques bactériologiques que pour la tuberculose. Le diagnostic différentiel avec les bacilles de la tuberculose est primordial et le diagnostic positif d'infection à mycobactérie atypique est difficile parce que les cultures positives sont le plus souvent le résultat de contamination à partir de l'environnement. L'identification précise de l'espèce, qui nécessite le plus souvent un laboratoire spécialisé, est nécessaire pour confirmer le diagnostic d'infection à mycobactérie atypique et choisir le traitement.

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