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Degeneracy in the genetic code and its symmetries by base substitutions - 11/01/08

Doi : 10.1016/j.crvi.2006.01.003 
Jean-Luc Jestin
Unité de chimie organique, département de biologie structurale et chimie, Institut Pasteur, 28, rue du Docteur-Roux, 75724 Paris cedex 15, France 

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Abstract

Degeneracy in the genetic code is known to minimise the deleterious effects of the most frequent base substitutions: transitions at the third base of codons are generally synonymous substitutions. Transversions that alter degeneracy were reported by Rumer. Here the other transversions are shown to leave invariant degeneracy when applied to the first base of codons. As a summary, degeneracy is considered with respect to all three types of base substitutions, the transitions and the two types of transversions. The symmetries of degeneracy by base substitutions are independent of the representation of the genetic code and discussed with respect to the quasi-universality of the genetic code. To cite this article: J.-L. Jestin, C. R. Biologies 329 (2006).

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

La dégénérescence du code génétique minimise les effets délétères des substitutions les plus fréquentes : les transitions à la troisième base de codons sont généralement synonymes. Des transversions qui altèrent la dégénérescence ont été rapportées par Rumer. Les autres transversions appliquées à la première base des codons laissent invariantes la dégénérescence. En résumé, la dégénérescence est considérée par rapport à lʼensemble des trois types de substitutions, les deux types de transversions et les transitions. Les symétries de la dégénérescence par substitutions de base sont indépendantes de la représentation du code génétique et sont discutées par rapport à la quasi-universalité de ce dernier. Pour citer cet article : J.-L. Jestin, C. R. Biologies 329 (2006).

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Keywords : Molecular evolution, Transition, Transversion, Mutation, Symmetry, Codon, Genetic code

Mots-clés : Évolution moléculaire, Transition, Transversion, Mutation, Symétrie, Codon, Code génétique


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Vol 329 - N° 3

P. 168-171 - mars 2006 Retour au numéro
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