Evaluation of genetic variability of sorghum (Sorghum bicolor L. Moench) in northwestern Morocco by ISSR and RAPD markers - 12/01/08
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Abstract |
The study of the genetic variability of the Moroccan landraces of sorghum constitutes a necessary step that can be exploited in the programs of improvement and valorisation of this marginalized species. The aim of this investigation is to evaluate the variability of sorghum populations and to establish their phylogenetic relations using RAPD and ISSR markers. Sampling was taken in 33 fields of northern regions where this species is most cultivated. Individual plants (398) were collected in 13, 11, 5, and 4 fields of Larache, Tangier, Chefchaouen, and Tetouan, respectively. Thirty-eight RAPD primers and four ISSR primers were used. The percentage of polymorphic fragments revealed with ISSR (98%) is higher than the one revealed with RAPD (85%). The level of the variability obtained through the two techniques is very high. Nevertheless, ISSR markers revealed more diversity than RAPD (
against 
). The classification based on Jaccardʼs similarity index distinguished the totality of fields. Data analysis revealed a genetic structure that is closely related to the micro-geographical repartition of the different fields. To cite this article: L. Medraoui et al., C. R. Biologies 330 (2007).
Résumé |
Lʼétude de la variabilité génétique des variétés-populations de sorgho grain marocain constitue une étape nécessaire à exploiter dans les programmes dʼamélioration et de valorisation de cette céréale marginalisée. Lʼobjectif de cette étude est dʼévaluer la variabilité des populations de sorgho et dʼétablir leurs relations phylogénétiques via les marqueurs RAPD et ISSR. Lʼéchantillonnage a été réalisé dans 33 champs au niveau de la région nord du Maroc, où cette espèce est largement cultivée. Il concerne 398 individus collectés respectivement dans 13, 11, 5 et 4 champs de Larache, Tanger, Chefchaouen et Tétouan. Trente-huit amorces RAPD et quatre amorces ISSR ont été utilisées. Le pourcentage de polymorphisme révélé avec ISSR (98%) est supérieur à celui révélé avec RAPD (85%). Le niveau de diversité obtenu par les deux techniques est élevé. Néanmoins, lʼISSR a montré plus de diversité que le RAPD (
, contre 
). La classification selon lʼindice de similarité de Jaccard a permis la distinction de la totalité des champs étudiés. Lʼanalyse des données a révélé une structure génétique qui est étroitement liée à la répartition micro-géographique des différents champs. Pour citer cet article : L. Medraoui et al., C. R. Biologies 330 (2007).
Keywords : Sorghum bicolor L. Moench, Moroccan landraces, Genetic variability, RAPD, ISSR
Mots-clés : Sorghum bicolor L. Moench, Variétés-populations, Variabilité génétique, RAPD, ISSR
Plan
Vol 330 - N° 11
P. 789-797 - novembre 2007 Retour au numéro
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