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The phylogeny and classification of caenophidian snakes inferred from seven nuclear protein-coding genes - 12/01/08

Doi : 10.1016/j.crvi.2006.10.001 
Nicolas Vidal a, b, , Anne-Sophie Delmas c, Patrick David b, Corinne Cruaud d, Arnaud Couloux d, S. Blair Hedges a
a Department of Biology and NASA Astrobiology Institute, 208 Mueller Lab, Pennsylvania State University, University Park, PA 16802-5301, USA 
b UMS 602, « Taxonomie et collections », Reptiles-Amphibiens, département « Systématique et Évolution », Muséum national dʼhistoire naturelle, CP 30, 57, rue Cuvier, 75231 Paris cedex 05, France 
c 7, rue dʼArsonval, 75015 Paris, France 
d Centre national de séquençage, Genoscope, 2, rue Gaston-Crémieux, CP 5706, 91057 Évry cedex, France 

Corresponding author.

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Abstract

More than 80% of the approximately 3000 living species of snakes are placed in the taxon Caenophidia (advanced snakes), a group that includes the families Acrochordidae, Viperidae, Elapidae, Atractaspididae, and the paraphyletic Colubridae'. Previous studies using DNA sequences have involved few nuclear genes (one or two). Several nodes have therefore proven difficult to resolve with statistical significance. Here, we investigated the higher-level relationships of caenophidian snakes with seven nuclear protein-coding genes and obtained a well-supported topology. Accordingly, some adjustments to the current classification of Caenophidia are made to better reflect the relationships of the groups. The phylogeny also indicates that, ancestrally, caenophidian snakes are Asian and nocturnal in origin, although living species occur on nearly all continents and are ecologically diverse. To cite this article: N. Vidal et al., C. R. Biologies 330 (2007).

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

Plus de 80% des 3000 espèces actuelles de serpents sont regroupées dans le taxon Caenophidia (serpents avancés), un groupe qui inclut les familles des Acrochordidae, des Viperidae, des Elapidae, des Atractaspididae, et des « Colubridae », cette dernière paraphylétique. Les études moléculaires précédentes nʼont utilisé quʼun nombre très restreint de gènes nucléaires (un ou deux). Cʼest pourquoi de nombreuses relations de parenté restent à résoudre de façon robuste. Dans ce travail, nous avons étudié la phylogénie des Caenophidia à lʼaide de sept gènes nucléaires codant pour des protéines, et avons obtenu une topologie bien soutenue. Par conséquent, des modifications sont apportées à la classification actuelle des Caenophidia. La phylogénie indique aussi que les Caenophidia sont dʼorigine asiatique et nocturne, bien que les espèces actuelles soient présentes sur presque tous les continents et soient écologiquement variées. Pour citer cet article : N. Vidal et al., C. R. Biologies 330 (2007).

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Serpentes, Colubroidea, Systematics, C-mos, RAG1, RAG2, R35, HOXA13, JUN, AMEL, Grayiinae

Mots-clés : Serpentes, Colubroidea, Systématique, C-mos, RAG1, RAG2, R35, HOXA13, JUN, AMEL, Grayiinae


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Vol 330 - N° 2

P. 182-187 - février 2007 Retour au numéro
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  • High spatial variability in coral bleaching around Moorea (French Polynesia): patterns across locations and water depths
  • Lucie Penin, Mehdi Adjeroud, Muriel Schrimm, Hunter Stanton Lenihan
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  • Erratum to the article: Periodic oscillations of the genomic nucleotide sequences disclose major differences in the way of constructing homologous proteins from different procaryotic species [C. R. Biologies 330 (2007) 13-32]
  • Piotr P. Slonimski

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