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Système sémantiquement interopérable de sélection semi-automatique des patients éligibles aux essais thérapeutiques en cancérologie - 28/03/12

ASTEC: Automatic selection of clinical trials based on eligibility criteria

Doi : 10.1016/j.irbm.2012.02.001 
M. Cuggia a, J.-C. Dufour b, O. Zekri c, I. Gibaud d, C. Garde e, C. Bohec f, R. Duvauferrier a, , D. Fieschi b, P. Besana a, L. Charlois b, A. Bourde a, N. Garcelon a, J. Laurent c, M. Fieschi b, O. Dameron a
a UMR 936, Inserm, université Rennes-1, 2, avenue Léon-Bernard, 35043 Rennes, France 
b LERTIM, université d’Aix-Marseille, 13005 Aix-Marseille, France 
c CRLCC centre Eugène-Marquis, Rennes, France 
d SIB, Rennes, France 
e ENOVACOM, Marseille, France 
f Réseau Onco, 35042 Bretagne, France 

Auteur correspondant.

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Résumé

ASTEC est un projet de recherche dont l’objectif est d’augmenter le taux d’inclusion des patients dans les essais cliniques de cancérologie grâce à l’exploitation automatique des données contenues dans le dossier médical informatisé. Le projet ASTEC explore deux enjeux scientifiques majeurs dans le champ de l’informatique médicale : 1) l’interopérabilité syntactique et sémantique entre systèmes d’information. Il s’agit ici de faire interopérer un dossier structuré informatisé avec un outil d’aide à la décision. Le projet ASTEC propose un cadre syntaxico-sémantique d’interopérabilité, basé sur des standards internationaux. Sont développées des méthodes génériques de médiation sémantique basées sur les ontologies pour adapter l’information issue des dossiers aux critères d’inclusion/exclusion des études cliniques ; 2) l’aide à décision : développer des méthodes d’inférence sur les dossiers patients en utilisant un formalisme de représentation adapté aussi bien à la structuration des données cliniques qu’à celle des critères d’inclusion et d’exclusion des essais cliniques. Nous exposons ici les choix procéduraux et technologiques retenus dans le cadre de ce projet. Il est, par ailleurs, prévu que durant le projet ASTEC, nous implémenterons et évaluerons le système en conditions réelles d’utilisation. L’hypothèse est que ce système permettra d’augmenter de façon significative le nombre de patients éligibles à l’inclusion dans les études cliniques de cancérologie.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Abstract

Automatic Selection of clinical Trial based on Eligibility Criteria (ASTEC) project is to automate, so as to make it systematic, the search of cancer clinical trials, by reusing the patient data contained into an oncologic electronic health record. ASTEC project tackles two major scientific challenges for medical informatics: 1) the syntactic and semantic interoperability between information systems. The oncologic electronic medical records and the recruitment decision system must be interoperable. The ASTEC project proposes a framework of syntactico-semantic interoperability based on international standards. Generic methods of mediation and reasoning based on ontologies are developed to match data from the electronic medical records to the inclusion/exclusion criteria of clinical trials; 2) a decision support system for recruitment. We have developed inference methods on the electronic medical records adapted to the data structure as well as the eligibility criteria. this paper, we present and justify our choices, concerning the medical process in oncology and the scientific and technical aspects. Furthermore the system will be evaluated in real time. The aim is to demonstrate a significative improvement of the prescreening rate of patient.

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Vol 33 - N° 2

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