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Development of Exon-Primed Intron-Crossing (EPIC) PCR primers for the malaria vector Anopheles pseudopunctipennis (Diptera: Culicidae) - 19/06/12

Doi : 10.1016/j.crvi.2012.05.002 
Frédéric Lardeux a, , b , Claudia Aliaga a, b, Rosenka Tejerina a, b, Raùl Ursic-Bedoya c
a Institut de recherche pour le développement (IRD), C.P. 9214 La Paz, Bolivia 
b Instituto Nacional de Laboratorios de Salud (INLASA), Laboratorio de Entomologia Medica, Rafael Zubieta no 1889, Casilla M-10019, Miraflores, La Paz, Bolivia 
c Simon Fraser University, Department of Biological Sciences, 8888 University Dr., Burnaby, BC V5A1S6, Canada 

Corresponding author.

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Abstract

Using the Anopheles gambiae Giles genome as a template, we designed, screened and identified 14 novel Exon-Primed Intron-Crossing (EPIC) PCR primer pairs for Anopheles pseudopunctipennis Theobald 1901, a major vector of human Plasmodium sp. in South America. These primers were designed to target the conserved regions flanking consecutive exons of different genes and enabled the amplification of 17 loci of which nine were polymorphic. Polymorphisms at these loci ranged from two to four alleles. Intron length polymorphism analysis is a useful tool, which will allow the study of the population structure of this mosquito species, which remains poorly understood.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

Utilisant le génome d’Anopheles gambiae Giles comme modèle, nous avons identifié 14 nouvelles Exon-Primed Intron-Crossing (EPIC) paires d’amorces PCR pour Anopheles pseudopunctipennis Theobald 1901, un vecteur majeur de Plasmodium sp. humains en Amérique du Sud. Ces amorces ont été conçues afin de cibler les régions conservées flanquant les exons consécutifs de différents gènes et ont permis l’amplification de 17 loci dont neuf étaient polymorphes. Le polymorphisme de ces loci varie de deux à quatre allèles. L’analyse du polymorphisme de longueur d’intron est un outil utile qui permettra l’étude de la structure de la population de cette espèce de moustique, qui demeure mal comprise.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : EPIC-PCR, Anopheles pseudopunctipennis, Malaria, Primer, Intron

Mots clés : EPIC-PCR, Anopheles pseudopunctipennis, Paludisme, Amorce, Intron


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Vol 335 - N° 6

P. 398-405 - juin 2012 Retour au numéro
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