El síndrome de Fanconi es secundario a un defecto más o menos generalizado de la reabsorción en los túbulos renales proximales, con una pérdida excesiva de aminoácidos, glucosa, fósforo, bicarbonato y otros electrólitos. Los niños afectados presentan retraso de crecimiento, raquitismo, poliuria y deshidratación. La causa más frecuente es la cistinosis. Ésta, de transmisión autosómica recesiva, es una enfermedad lisosómica caracterizada por la acumulación de cistina en todos los tejidos y órganos. El gen causal, CTNS, codifica la cistinosina, un transportador lisosómico de cistina. La anomalía observada en el 60-70% de los niños con síndrome de Fanconi originarios de Europa del Norte, es una gran deleción de 57 kb. Se han descrito alrededor de 80 mutaciones del gen CTNS. En la forma infantil de la enfermedad, al comienzo prevalece un síndrome de Fanconi, que se manifiesta entre los 3-6 meses. Sin tratamiento, la lesión renal avanza hacia la insuficiencia renal terminal después de los 6 años de edad. Los depósitos corneales de cistina causan fotofobia. Las otras manifestaciones son más tardías: insuficiencia tiroidea, diabetes mellitus, miopatía y encefalopatía. El diagnóstico se basa en la determinación biológica de la concentración de cistina intraleucocítica, que está elevada. El tratamiento consiste en una compensación de las pérdidas urinarias de agua y electrólitos, en la administración de indometacina y en un tratamiento de fondo con cisteamina, que permite la depleción de cistina de las células. Las otras enfermedades responsables de un síndrome de Fanconi en el niño son genéticas en su mayoría, en especial la intolerancia a la fructosa, la galactosemia, la tirosinosis, la enfermedad de Wilson, las glucogenosis, la enfermedad de Dent, el síndrome de Lowe y las citopatías mitocondriales.