Since a few years, numerous new diagnostic tools are available for bacterial diagnosis. Biochemical and immunologic tests, molecular biology and mass spectrometry provide results faster than gold standard methods. This enables early adjustment of therapeutics to provide appropriate care to patients. However, these tests have also some limitations and their analytical performances have to be known in order to settle their position in global diagnostic strategies, depending on local conditions. This review describes methods providing rapid bacterial diagnosis and develops two examples of applications: mycobacterial infections diagnosis and Clostridium difficile infection diagnosis.

Après avoir longtemps reposé sur des techniques classiques (culture sur géloses, identification biochimique…), l’expertise bactériologique dispose depuis quelques années de nouveaux outils diagnostiques. Les tests biochimiques ou immunologiques, la biologie moléculaire et la spectrométrie de masse permettent désormais d’obtenir des résultats plus rapidement que les méthodes de référence, ce qui favorise une prise en charge adaptée précoce des patients. Cependant, ces tests ont aussi leurs limites et leurs performances analytiques doivent être connues afin de les intégrer dans une stratégie diagnostique globale, adaptée au contexte local. Cette revue décrit les méthodes de diagnostic rapide disponibles à ce jour en bactériologie et développe deux exemples d’applications : le diagnostic des infections à mycobactéries et celui des infections à Clostridium difficile.