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Spectrométrie de masse et microbiologie - 26/11/13

Mass spectrometry and microbiology

Doi : 10.1016/j.immbio.2013.09.003 
A. Gravet , M. Gessier
 Laboratoire de microbiologie, hôpital Emile-Muller, 20, avenue du Dr-Laennec, 68070 Mulhouse, France 

Auteur correspondant.

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Summary

Matrix laser desorption assisted time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) is applied for identification of microorganisms in more and more hospital or private laboratories. The technique is easy to use, fast and reliable. MALDI-TOF MS identification is an efficient method, included fastidious bacteria and replaces more and more conventional identification techniques for bacterial and fungal strains. It is widely used in routine laboratory practice because of its economical and diagnostic benefits. The databases are gradually enhancing significant new taxa, requiring controlled and rigorous development. The specific standardized protocols are established to identify mycobacteria, filamentous fungi. Several systems available for routine procedures are equally systems in terms of analytical efficiency. The MALDI-TOF MS is a relevant tool for detection of resistance as well as identification of microorganism in sample. The opportunities are important, this technology is a potential efficient tool for epidemiological studies and for taxonomical classification. It also includes limits that must be integrated and managed into the routine laboratory while keeping the side expert of the technician and the biologist.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

La technique Matrix laser desorption assisted time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF) est une nouvelle technique d’identification des microorganismes utilisée dans un nombre croissant de laboratoires publiques et privés. Elle est facile à utiliser, rapide, fiable et économique. La méthode est très performante, y compris pour l’identification des bactéries fastidieuses, des mycobactéries, des champignons filamenteux. Des protocoles normalisés spécifiques de préparation des dépôts sont mis au point pour identifier certains microorganismes. Les bases de données sont régulièrement améliorées par l’inclusion de nouveaux taxons. Ces ajouts doivent être contrôlés et rigoureux. Plusieurs systèmes sont disponibles sur le marché, avec des résultats globalement comparables en termes d’efficacité analytique. La spectrométrie de masse est un outil pertinent pour la détection de la résistance des bactéries aux antibiotiques, l’identification directement dans l’échantillon mais des développements sont nécessaires pour l’intégration à la routine. Les perspectives de développement sont importantes, cette technologie est un outil potentiellement efficace pour les études épidémiologiques et pour classification taxonomique. Elle comprend également des limites et doit être intégrée dans le laboratoire de routine tout en préservant l’expertise des techniciens et des biologistes.

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Keywords : Microbiology, Bacteriology, MALDI-TOF, Mass spectrometry, Microorganism identification, Routine laboratory

Mots clés : Microbiologie, Bactériologie, MALDI-TOF, Spectrométrie de masse, Identification, Laboratoire de routine


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Vol 28 - N° 5-6

P. 297-308 - octobre 2013 Retour au numéro
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