Le diabète et l’hypertension ont une composante génétique dont une proportion de l’héritabilité manquante pourrait être due à des variations du nombre de copies (CNV) de gènes. Afin d’identifier ces variations, nous avons procédé à des criblages génomiques complets (GWAS) de CNV avec plusieurs phénotypes et complications du diabète de de type 2 (DT2).

Les GWAS ont été faits chez 3 449 patients d’origine caucasienne ayant participé à l’étude clinique ADVANCE. 31 phénotypes micro- et macrovasculaires quantitatifs et 23 phénotypes qualitatifs ont été déterminés. Les génotypes du nombre de copies ont été déterminés à l’aide de puces d’ADN d’Affymetrix 6.0 et 5.0 par les algorithmes PennCNV et ParseCNV. Le niveau de significativité a été déterminé empiriquement en répétant les analyses GWAS avec des données permutées.

19 délétions et 9 duplications sont significativement associées à 12 phénotypes qualitatifs alors que 7 délétions et 4 duplications sont significativement associées à 9 phénotypes quantitatifs. Parmi ceux-ci, on retrouve plusieurs CNV associés significativement à l’hypertension. Une délétion fréquente au locus 3p14.1 dans le gène FAM19A4 est associée à l’hypertension chez les femmes et une délétion protective au chr2 : 49386546-49394694 à 151,4kb en amont du gène FSHR est aussi associé à l’hypertension chez les femmes. Or, les souris femelles KO pour ce gène sont hypertendues. Des CNV qui incluent des délétions et des duplications dans un cluster de gènes KRTAP9 sur le chr17q21.2 ainsi qu’une duplication sur le chr11p15.4 dans le gène TRIM22 sont significativement associés à l’hypertension chez les deux sexes.

Nos résultats ont permis d’identifier des CNV associés à l’hypertension chez les patients diabétiques. Ces CNV seront validés dans d’autres populations et leur importance sera évaluée sur la fonction de ces gènes ainsi que sur leur valeur prédictive des issus cliniques.