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Interleukin-23 receptor single nucleotide polymorphisms in ulcerative colitis. A study in Iranian populations - 17/06/14

Doi : 10.1016/j.clinre.2013.12.008 
Nasser Ebrahimi Daryani a, Farnaz Najmi Varzaneh b, Mona Hedayat c, Mohammad Taher a, Elham Farhadi a, d, Mahdi Mahmoudi e, Mohammad Hossein Nicknam b, Mohammad Bashashati f, Nima Rezaei b, g,
a Department of Gastroenterology and Hepatology, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran 
b Molecular Immunology Research Center, Department of Immunology, School of Medicine, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran 
c Division of Immunology, Boston Children's Hospital, Harvard Medical School, Boston, MA, USA 
d Hematology Department, School of Allied Medical Science, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran 
e Rheumatology Research Center, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran 
f Gastrointestinal Research Group, University of Calgary, Calgary, AB, Canada 
g Research Center for Immunodeficiencies, Children's Medical Center, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran 

Corresponding author. Children's Medical Center Hospital, Dr Qarib St, Keshavarz Blvd, Tehran 14194, Iran. Tel.: +9821 6692 9234; fax: +9821 6692 9235.

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Summary

Background/objective

Genetic factors seem to play an important role in the pathogenesis of ulcerative colitis (UC). Genome wide association studies showed a highly significant association between interleukin 23 receptor (IL23R) single nucleotide polymorphisms (SNPs) and Crohn's disease; however, there are contrary results regarding the disease-modifying effects of IL23R variants in UC. This study was performed in a group of patients with UC to test the possible role of IL23R SNPs in conferring susceptibility or protection against the disease.

Methods

The study was performed on 67 Iranian adult patients with UC and 78 healthy controls. Eight IL23R SNPs were genotyped, using real-time polymerase chain reaction (RT-PCR). The frequencies of alleles and genotype at each position were determined and compared between two groups of patients and controls.

Results

The frequency of the T allele at position rs1343151 was significantly higher in the patient group, compared to the controls (P=0.018). The TT genotype at the same position was also significantly overrepresented in the patient group (P=0.02). There was no significant difference in alleles and genotype frequencies of other SNPs between patients and controls.

Conclusions

This study identified a new susceptibility locus associated with UC. Our findings provide further insight into the genetics of UC, which might be amenable to future therapeutic intervention.

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Vol 38 - N° 3

P. 360-365 - juin 2014 Retour au numéro
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  • Association between TLR2, MTR, MTRR, XPC, TP73, TP53 genetic polymorphisms and gastric cancer: A meta-analysis
  • Chen Cheng, Wang Lingyan, Huang Yi, Zhang Cheng, Ye Huadan, Xu Xuting, Xu Leiting, Ye Meng, Duan Shiwei
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  • Associations of a TLR4 single-nucleotide polymorphism with H. pylori associated gastric diseases in iranian patients
  • Nader Bagheri, Fatemeh Azadegan-Dehkordi, Hosein Sanei, Afshin Taghikhani, Ghorbanali Rahimian, Loghman Salimzadeh, Morteza Hashemzadeh-Chaleshtori, Mahmoud Rafieian-kopaei, Maryam Shirzad, Hedayatollah Shirzad

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