S'abonner

Polymerase chain reaction–denaturing gradient gel electrophoresis (PCR–DGGE): A promising tool to diagnose bacterial infections in diabetic foot ulcers - 02/12/14

Doi : 10.1016/j.diabet.2014.03.002 
C. Dunyach-Remy a, b, A. Cadière c, J.-L. Richard d, S. Schuldiner d, S. Bayle e, B. Roig c, A. Sotto a, J.-P. Lavigne a, b,
a Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, U1047, Université de Montpellier 1, 30908 Nîmes, France 
b Department of Microbiology, CHU Carémeau, 30029 Nîmes, France 
c EHESP Rennes, Sorbonne Paris Cité, INSERM-UMR-IRSET, U1085, LERES, 35000 Rennes, France 
d Department of Diabetology, CHU de Nîmes, 30240 Le Grau-du-Roi, France 
e Centre LGEI, École des Mines d’Alès, 30100 Alès, France 

Corresponding author. INSERM, U1047, Université de Montpellier 1, UFR de Médecine, 186, chemin du Carreau-de-Lanes, 30908 Nîmes cedex 02, France. Tel.: +33 4 66 68 32 02; fax: +33 4 66 68 42 54.

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
Article gratuit.

Connectez-vous pour en bénéficier!

Abstract

Aim

The diagnosis of diabetic foot infections is difficult due to limitations of conventional culture-based techniques. The objective of this study was to evaluate the contribution of denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) in the microbiological diagnosis of diabetic foot ulcers in comparison to conventional techniques, and also to evaluate the need to perform a biopsy sample for this diagnosis.

Methods

Twenty diabetic patients (types 1 and 2) with foot ulcers (grades 1–4) were included. After debridement of their wounds, samples were taken in duplicate by surface swabbing and deep-tissue biopsy. The samples were analyzed by conventional culture and by a new molecular biology tool, DGGE technology.

Results

Polymerase chain reaction (PCR)–DGGE led to the identification of more bacteria than did conventional cultures (mean: 2.35 vs 0.80, respectively). In 11 cases, the technology detected pathogenic species not isolated by classical cultures. PCR–DGGE also identified significantly more pathogenic species at deep levels compared with species detected at superficial levels (87% vs 58%, respectively; P=0.03). In 9/20 cases, pathogenic bacteria were detected only in deep samples, revealing the need to perform tissue biopsy sampling.

Conclusion

DGGE, achievable in 48h, could be a useful technique for the bacteriological diagnosis of diabetic foot infections. It may help to identify pathogenic bacteria in deeply infected ulcers, thereby contributing to a more appropriate use of antibiotics.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Denaturing gradient gel electrophoresis, Diabetic foot ulcer, Diagnostic, Ecology, Infection, Antibiotic treatment


Plan


© 2014  Elsevier Masson SAS. Tous droits réservés.
Ajouter à ma bibliothèque Retirer de ma bibliothèque Imprimer
Export

    Export citations

  • Fichier

  • Contenu

Vol 40 - N° 6

P. 476-480 - décembre 2014 Retour au numéro
Article précédent Article précédent
  • Perceived psychosocial stress and glucose intolerance among pregnant Hispanic women
  • M.L. Silveira, B.W. Whitcomb, P. Pekow, B. Braun, G. Markenson, N. Dole, J.E. Manson, C.G. Solomon, E.T. Carbone, L. Chasan-Taber
| Article suivant Article suivant
  • Switching from insulin glargine to insulin degludec reduced HbA1c, daily insulin doses and anti-insulin antibody in anti-insulin antibody-positive subjects with type 1 diabetes
  • H. Hamasaki, H. Yanai

Bienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.

Mon compte


Plateformes Elsevier Masson

Déclaration CNIL

EM-CONSULTE.COM est déclaré à la CNIL, déclaration n° 1286925.

En application de la loi nº78-17 du 6 janvier 1978 relative à l'informatique, aux fichiers et aux libertés, vous disposez des droits d'opposition (art.26 de la loi), d'accès (art.34 à 38 de la loi), et de rectification (art.36 de la loi) des données vous concernant. Ainsi, vous pouvez exiger que soient rectifiées, complétées, clarifiées, mises à jour ou effacées les informations vous concernant qui sont inexactes, incomplètes, équivoques, périmées ou dont la collecte ou l'utilisation ou la conservation est interdite.
Les informations personnelles concernant les visiteurs de notre site, y compris leur identité, sont confidentielles.
Le responsable du site s'engage sur l'honneur à respecter les conditions légales de confidentialité applicables en France et à ne pas divulguer ces informations à des tiers.


Tout le contenu de ce site: Copyright © 2024 Elsevier, ses concédants de licence et ses contributeurs. Tout les droits sont réservés, y compris ceux relatifs à l'exploration de textes et de données, a la formation en IA et aux technologies similaires. Pour tout contenu en libre accès, les conditions de licence Creative Commons s'appliquent.