La compréhension des adaptations métaboliques et moléculaires du tissu adipeux (TA) accompagnant une perte de poids est essentielle dans le cadre de la recherche sur la physiopathologie de l’obésité. Dans ce contexte, les omiques, et particulièrement la génomique du TA, ont permis d’améliorer la connaissance de ces adaptations. Une approche innovante est d’intégrer les jeux de données de plusieurs types de omiques afin d’avoir une vue globale et exhaustive sur les interactions entre chaque variable et de les relier à des évènements cliniques, tels les variations de poids.

Le but de ce travail était d’étudier les relations entre des variables bio-cliniques d’individus obèses, l’expression des gènes et le contenu en acides gras (AG) du TA, à chaque étape d’un programme nutritionnel et en relation avec les variations pondérales.

La détermination du contenu en AG du TA sous cutané abdominal et les mesures d’expression de 221 gènes ont été réalisées chez 135 femmes obèses de la cohorte européenne DiOGenes, avant le régime, après une phase de restriction calorique de 8 semaines et après 6 mois de suivi pondéral ad libitum. Les individus ont été stratifiés a posteriori en 3 groupes selon les variations de poids après la restriction. Afin d’étudier les relations entre les 3 jeux de données (AG, transcrits, variables bio-cliniques), une analyse de réseau basée sur un modèle graphique gaussien a été utilisée. Au sein de chaque jeu de données, les relations entre les variables ont été établies par estimation des corrélations partielles. Les relations entre les variables de 2 jeux de données ont été étudiées par une analyse de corrélations canoniques régularisées. Une approche intégrative a permis de fusionner tous les types de relations. Pour faire ressortir la macro-structure des réseaux, une classification de sommets a été utilisée, permettant de générer des sous-réseaux. Les principaux sommets des sous-réseaux ont été extraits et leur importance (centrealité) testée statistiquement. La fonction biologique des variables composant ces sous-réseaux réseaux a été analysée.

À la fin de la phase de suivi et dans le groupe de femmes reprenant du poids, 3 sous-réseaux sur 5 montrent des gènes impliqués dans des voies de croissance, angioge-nèse et signalisation de prolifération, suggérant une hyperplasie. Après la phase de restriction, une relation positive forte entre l’acide myristoléïque (un AG peu représenté dans le TA et dans l’alimentation) et des gènes codant pour les principales enzymes de la lipogenèse de novo a été observée. À la fin de la phase de suivi, dans le groupe de femmes qui ont continué à perdre du poids, cette relation entre acide myristo-léïque et gènes de la lipogenèse de novo est également retrouvée.

Cette approche originale de biologie des systèmes apporte un regard nouveau sur la réponse du TA au contrôle pondéral, en soulignant le rôle central et inattendu de l’acide myristo-léïque, qui pourrait être un déterminant de l’impact métabolique bénéfique de la perte de poids. La signature spécifique du TA des femmes reprenant du poids suggère au contraire une signature hyperplasique défavorable.