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Neurofibromatosis type 2 French cohort analysis using a comprehensive NF2 molecular diagnostic strategy - 29/10/18

Neurofibromatose de type 2 : analyse de la cohorte française par une stratégie exhaustive d’analyse moléculaire du gène NF2

Doi : 10.1016/j.neuchi.2015.01.004 
E. Pasmant a, b, C. Louvrier b, A. Luscan a, b, J. Cohen b, I. Laurendeau a, M. Vidaud a, b, D. Vidaud a, b, S. Goutagny c, M. Kalamarides d, B. Parfait a, b,
a EA7331, faculté de pharmacie de Paris, université Paris Descartes, Sorbonne Paris Cité, Paris, France 
b Service de biochimie et de génétique moléculaire, hôpital Cochin, AP–HP, Paris, France 
c Service de neurochirurgie, hôpital Beaujon, AP–HP, Clichy, France 
d Service de neurochirurgie, hôpital Pitié-Salpétrière, AP–HP, Paris, France 

Corresponding author.

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Abstract

Objective

Neurofibromatosis type 2 (NF2) affects about one in 25,000 to 40,000 people. Most NF2 patients have private loss-of-function mutations scattered along the NF2 gene. Here, we present our NF2 investigation strategy.

Material and methods

We report a comprehensive NF2 mutation analysis of 221 NF2 French patients: 134 unrelated typical NF2 patients fulfilling the Manchester criteria and 87 unrelated patients presenting symptoms that partially fulfilled the Manchester criteria.

Results

A NF2 mutation was identified in 56 of the 221 patients, giving a global mutation detection rate of 25%. This rate reached 37% (49/134) for typical NF2 patients fulfilling the Manchester criteria and only 8% (7/87) for patients presenting symptoms suggestive of NF2. Six of these seven patients were under 25 of age. Our approach showed that 77% of NF2 identified variants were detected by coding exons sequencing. Multiplex ligation-dependent probe amplification allowed the identification of restricted rearrangements (23% of NF2 identified variants corresponding to complete deletion or partial deletion/duplication of NF2).

Conclusion

High mutation detection rate can be achieved if well phenotyped NF2 patients are studied with multiple complementary and optimized techniques. NF2 somatic mosaicism detection was improved by frozen tumor samples molecular analysis.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

Objectif

La neurofibromatose de type 2 (NF2) atteint environ une personne sur 25 000 à 40 000. La plupart des patients atteints de NF2 présentent des mutations privées de type perte-de-fonction, qui sont réparties sur l’ensemble du gène NF2. Nous présentons ici notre stratégie d’analyse moléculaire du gène NF2.

Patients et méthodes

Une analyse moléculaire exhaustive du gène NF2 a été réalisée chez 221 patients français atteints de NF2 : 134 patients non apparentés « typiques » répondant aux critères de Manchester et 87 patients non apparentés présentant des symptômes évocateurs de NF2, répondant seulement partiellement aux critères de Manchester.

Résultats

Une mutation de NF2 a été identifiée chez 56 des 221 patients, soit un taux global de détection de 25 %. Ce taux atteignait 37 % (49/134) pour les patients « typiques » répondant aux critères de Manchester et seulement 8 % (7/87) pour les patients avec un phénotype évocateur de NF2. Six de ces sept patients étaient âgés de moins de 25ans. Dans notre approche moléculaire, 77 % des variants de NF2 ont été retrouvés par séquençage des régions codantes du gène. La MLPA a permis la détection de réarrangements de NF2 (23 % des variants identifiés de NF2 correspondaient à des délétions complètes ou à des délétions/duplications partielles de NF2).

Conclusion

Un très bon taux de détection de mutation peut être obtenu chez des patients correctement phénotypés et par une étude moléculaire incluant des techniques complémentaires et optimisées. La détection des mosaïques somatiques peut en particulier être améliorée en analysant des échantillons tumoraux congelés.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Neurofibromatosis type 2, NF2, Manchester criteria, Multiplex ligation-dependent probe amplification, MLPA, Somatic mosaicism

Mots clés : Neurofibromatose de type 2, NF2, Critères de Manchester, Multiplex ligation-dependent probe amplification, MLPA, Mosaïque somatique


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Vol 64 - N° 5

P. 335-341 - novembre 2018 Retour au numéro
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  • M. Kalamarides
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  • M. Peyre, D. Bernardeschi, O. Sterkers, M. Kalamarides

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