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Utilisation en routine de l'amplification génique pour le diagnostic de coqueluche chez l'enfant - 01/01/02

F.  Doucet-Populaire a * ,  N.  Bourgeois a ,  O.  Charara b ,  M.  Bellaïche b ,  F.  Richardin c ,  J.-L.  Salomon d ,  L.  Berardi-Grassias c ,  J.-C.  Ghnassia a ,  P.  Foucaud b *Auteur correspondant

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Résumé

Objectifs. - Afin de pouvoir bénéficier d'un diagnostic précoce de coqueluche dans un contexte épidémiologique de résurgence, nous avons développé, en parallèle de la culture, une technique d'amplification génique (PCR) spécifique de Bordetella pertussis à partir des sécrétions nasopharyngées. L'objectif de notre étude était de montrer l'intérêt de cette technique dans le diagnostic de routine de la coqueluche chez l'enfant.

Matériel et méthodes. - De novembre 1996 à août 2000, les enfants consultant pour une toux quinteuse mal supportée compatible avec un diagnostic de coqueluche ont été inclus. Un questionnaire incluant des items cliniques, biologiques et radiologiques était établi pour chaque enfant. Une culture de Bordetella sur milieu de Regan-Lowe et une détection par PCR de B. pertussis étaient réalisées sur un prélèvement nasopharyngé. Le diagnostic de coqueluche était retenu si la recherche était positive en PCR et/ou en culture.

Résultats. - Sur 215 enfants, le diagnostic de coqueluche a été porté chez 45 (20,9 %), dont 39 étaient âgés de moins d'un an (médiane : trois mois). Sur ces 45 cas, 16 (35,5 %) étaient positifs à la fois en PCR et culture, 26 (57,8 %) en PCR uniquement et trois (6,7 %) seulement en culture. La PCR a permis un diagnostic bactériologique dans 93,3 % des cas dans un délai moyen de 48 heures. La culture n'a été positive que dans 61,2 % des cas dans un délai moyen de six jours. La répartition mensuelle des cas de coqueluche est très inhomogène, d'allure épidémique. La majorité des cas se situait dans deux périodes : 42 % entre novembre 1996 et septembre 1997 et 40 % entre novembre 1999 et août 2000. Parmi les nourrissons infectés, 15 étaient âgés de moins de deux mois et n'avaient donc pu être vaccinés ; parmi les 24 autres, un retard dans le calendrier vaccinal a pu être constaté dans 50 % des cas. Quatre enfants âgés de six à 14 ans avaient été correctement vaccinés. L'évolution a été favorable chez tous les enfants.

Conclusion. - La PCR par sa sensibilité, sa spécificité et sa rapidité, offre au clinicien un outil performant pour le diagnostic de coqueluche. La culture doit cependant y être associée, afin de suivre l'épidémiologie et la sensibilité aux antibiotiques des B. pertussis.

Mots clés  : Amplification génique ; PCR ; Coqueluche.

Abstract

Objectives. - The resurgence of whooping cough observed in France convinced us to develop a specific PCR assay to detect B. pertussis in nasopharyngeal secretions in parallel of the culture. The aim of our study was to show the value of the PCR in routine diagnosis.

Material and methods. - From November 1996 to August 2000, in two hospitals located in the Yvelines (France), the children consulting for a cough compatible with the diagnosis of whooping cough were included in this study. A questionnaire including clinical, biological and radiological items was completed for each one of these patients. A culture of Bordetella and a detection by PCR of B. pertussis were carried out on each nasopharyngeal aspirate. The diagnosis of whooping cough was retained if the detection was positive in PCR and/or culture.

Results. - Among the 215 investigated children with suspected cases of whooping cough, the diagnosis was positive for 45 (20.9%), of which 39 were less than one year old (median: three months). Sixteen (35.5,%) were positive at the same time for both the PCR and the culture, 26 (57.8%) for only PCR and three (6.7%) for only culture. The PCR was positive in 93.3% of the cases. The results were obtained with an average time of 48 hours. The culture was positive in 61.2% of the cases with an average time of six days. The monthly distribution of the cases of whooping cough was very inhomogeneous and of epidemic appearance. The majority of the cases was located between two periods: 42% between November 1996 and September 1997 and 40% between November 1999 and August 2000. Among the infected children, 15 were less than two months old and were not yet vaccinated ; among the 24 others infants, a delay in the vaccine calendar was noted in 50% of the cases. Four children between six and 14 years old were correctly vaccinated. The evolution was favourable in all the children.

Conclusion. - The PCR due to its sensitivity, its specificity and its rapidity offers to the clinician a powerful tool for the diagnosis of whooping cough. Nevertheless, the culture must be associated with the PCR, in order to follow the epidemiology and the sensitivity to antibiotics of B. pertussis.

Mots clés  : Whooping cough ; Polymerase chain reaction ; Bordetella pertussis ; Child ; Infant.

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Vol 9 - N° 11

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