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Gastroentérologie Clinique et Biologique
Vol 29, N° 8-9  - août 2005
Doi : GCB-8-9-2005-29-8-0399-8320-101019-200515128
Hépatites Virales

CA42
DUPLICATION DU DOMAINE V3 DE LA PROTÉINE NON STRUCTURALE 5A DU VIRUS DE L'HÉPATITE C DE GÉNOTYPE 1B
 

P Veillon [1], H Le Guillou-Guillemette [1], B Coeffic [2], JF Subra [3], X Causse [4], P Dubois [5], A Blanchi [6], C Gaudy [7], C Payan [1], F Lunel-Fabiani [1]
[1] Laboratoire de Bactériologie-Virologie, CHU Angers
[2] EFS Pays de la Loire, Site d'Angers
[3] Service de Néphrologie, CHU Angers
[4] Service d'Hépatogastroentérologie, CHR La Source, Orléans
[5] Réseau Hépatites 49, CHU Angers
[6] Service d'Hépatogastroentérologie, CHU Le Mans
[7] Département de Microbiologie Médicale et Moléculaire, EA 3250, Université François Rabelais, Tours.

Introduction

La protéine non structurale NS5A du virus de l'hépatite C (VHC) a été impliquée dans la résistance au traitement par l'Interféron (IFN) dans plusieurs études cliniques au Japon et en Europe. Plusieurs interactions cellulaires ont été rapportées pour la protéine NS5A, mais sa fonction dans le cycle viral n'est pas encore connue. Quelques auteurs ont décrit des insertions nucléotidiques dans différentes régions du génome : 5'NC, HVR1 (protéine E2), ISDR (protéine NS5A), de 1 à 12 nucléotides (nts) (4 acides aminés, aa). Dans cette étude, nous décrivons une nouvelle insertion dans le génome du VHC et particulièrement dans la région V3 de la protéine.

Malades et méthodes

Nous avons amplifié la seconde moitié du gène NS5A, comprenant les régions ISDR et V3 chez 240 malades infectés le VHC de génotype 1b, puis séquencé les produits de PCR.

Résultats

Parmi les 240 malades analysés, nous avons trouvé 7 malades (2,9 %) présentant une insertion dans la séquence la région NS5A sans coupure dans le cadre de lecture. Deux tailles d'insert ont été trouvées, 6 malades avaient une insertion de 31 aa (93 nts) et un malade avait une insertion de 27 aa (81 nts). Cette insertion est située en aval de la région V3 (2353-2379, 27 aa) dans la région C-terminale de la protéine NS5A. Ces différentes insertions ont une grande ressemblance avec le premier domaine V3 mais sont toutes les sept différentes (environ 70 % d'homologie). Les quatre aa supplémentaires sont potentiellement les 4 aa situés en aval de la région V3. Seulement trois malades ont été traités. Un malade était un répondeur virologique soutenu après un traitement IFN à 6 MU 3 fois par semaine et les deux autres malades des non-répondeurs à leur traitement. Deux des sept malades présentant cette insertion dans le génome du VHC qui les infectait, étaient des transplantés rénaux.

Conclusion

Nous avons trouvé une nouvelle insertion, chez sept malades, située dans la région V3 de la protéine NS5A. La fonction de cette protéine n'est pas encore bien connue et les conséquences de cette duplication de la région V3 sont encore sujettes à discussion. L'étude de la protéine NS5A mérite encore des études pour comprendre son rôle dans la résistance au traitement, la réplication ou d'autres fonctions cellulaires.





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