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Gastroentérologie Clinique et Biologique
Vol 29, N° 8-9  - août 2005
Doi : GCB-8-9-2005-29-8-0399-8320-101019-200515129
Hépatites Virales

CA43
ANALYSE PHYLOGÉNÉTIQUE ET PAR CORRÉLATION DE MATRICES DES VOIES DE TRANSMISSION DU VIRUS DE L'HÉPATITE C DANS LE VILLAGE DE ZAWAIT RAZIN (ÉGYPTE)
 

C Féray [1], M El-Daly [2], M Abdel-Hamid [3], S El-Kafrawy [2], A Fontanet [4], C Rekacewicz [4], F Rimlinger [5], MK Mohamed [6], V Thiers [5]
[1] INSERM U-481, Faculté de Médecine Xavier Bichat, Paris
[2] National Liver Institute Menoufia, Egypte
[3] Minia University, Egypte
[4] Institut Pasteur, Paris
[5] Laboratoire Mixte Pasteur-Necker, CNR Hepatites Virales B ETC, Institut Pasteur
[6] Ain Shams University Faculty of Medicine, Le Caire, Egypte.

La prévalence du VHC dans la population égyptienne est l'une des plus élevées au monde. La pratique massive d'injections à but curatif (bilharziose) jusqu'au début des années 80 en est largement responsable. Quelles sont les voies d'infections actuelles dans cette population ?

Malades

133 sujets (67 hommes, âge moyen 36 ans (± 14 ; 9-75 ans) infectés par le VHC (ARN VHC positif génotype 4 dans 132 cas) du village de Zawait Razin, dans le delta du Nil ont été prélevés en 2002. Ces 133 sujets habitaient dans 54 maisons différentes abritant au moins deux personnes ARN VHC positif, permettant la comparaison des souches infectant deux époux dans 12 cas ; une mère et son enfant dans 9 cas ; un père et son enfant dans 11 cas, deux membres d'une fratrie dans 18 cas ; et 69 sujets sans lien familial direct avec un autre sujet de cette cohorte. Les séquences (directes) de la région NS5B étaient disponibles chez tous, et celles de la région E1 chez 66. Les distances de Kimura étaient calculées dans toutes les combinaisons de souches (N = 8778). L'hypothèse est que plus petite est la distance génétique entre deux souches virales, plus la probabilité d'une identité phénotypique est forte (même maison, relation époux, père-enfant, mère-enfant, même fratrie, différence d'âge faible, même sexe). Pour ce problème d'étude de corrélation de matrices, nous avons appliqué le test de Mantel, le test de Mantel partiel (Smouse-Long-Sokal) ainsi qu'une méthode de régressions multiples utilisant la permutation (logiciel Permute, P Legendre, Montréal).

Résultats

Les arbres phylogénétiques montrent à l'évidence un regroupement des souches suivant les maisonnées et suivant les familles sans que la part de l'un ou de l'autre de puisse être discernée. Par analyse de Mantel (univariée), les distances entre deux souches étaient plus petites si les sujets index habitaient la même maison (d = 0.08 vs 0.15 ± 0,9), avaient des rapports mère-enfant (d = 0.02 ± 02 vs 0.14 ± 0,1) ou appartenaient à la même fratrie (d = 0.02 ± 0,02 vs 0.15 ± 0,11). En analyse multivariée, la maison (P ≪ 0.0001), les relations mère-enfants (P = 0.002) et les relations de fratrie (P = 0.005) étaient les seules significatives. Aucune corrélation significative n'existait entre époux et entre père et enfant. L'analyse avec la séquence E1 donnait des résultats identiques. Dans le sous-groupe des 69 sujets sans liens familiaux, l'importance de la maison était confirmée.

Conclusion

Il s'agit de la première utilisation du test de Mantel pour aborder un problème de transmission virale. Le modèle suggère fortement trois voies indépendantes de contamination dans cette population hyperendémique : au sein des maisonnées, entre mères et enfants, et entre enfants d'une même famille.





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