An iterative procedure for differential analysis of gene expression - 01/01/03
Avner
Bar-Hen
a
,
Stéphane
Robin
b
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Résumé |
Microarrays are a popular technology to study genes that are differentially expressed between two conditions. In this Note, we propose an iterative procedure to determine the biggest subset of non-differentially expressed genes. We prove a pseudo Markov relationship that allows practical computations. We obtain explicit expressions for FDR and the level of the proposed test at each step. To cite this article: A. Bar-Hen, S. Robin, C. R. Acad. Sci. Paris, Ser. I 337 (2003).
Résumé |
Les biopuces constituent une technologie très utilisée pour étudier si des gènes s'expriment différemment entre deux conditions. Dans cette Note nous proposons une méthode itérative pour rechercher le plus grand sous-ensemble de gènes non-différentiellement exprimés. Nous prouvons une relation de type chaîne de Markov d'ordre deux qui simplifie fortement les calculs. Nous obtenons de manière explicite le FDR associé à notre procédure ainsi que le niveau du test à chaque étape. Pour citer cet article : A. Bar-Hen, S. Robin, C. R. Acad. Sci. Paris, Ser. I 337 (2003).
Plan
Vol 337 - N° 5
P. 343-346 - septembre 2003 Retour au numéro
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