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Nucleophilicity of zinc-bound thiolates - 21/04/09

Doi : 10.1016/j.crci.2009.01.002 
Delphine Picot, Gilles Ohanessian, Gilles Frison
Laboratoire des mécanismes réactionnels, Département de chimie, École polytechnique and CNRS, 91128 Palaiseau cedex, France 

Corresponding author.

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Abstract

The nucleophilicity of biomimetic zinc–thiolate complexes against methyl iodide has been studied. The activation barrier has been computed with the B3LYP functional. The reactivity depends on the global charge, the nature of the ligand set and the presence of hydrogen bonds. This shows that the understanding of zinc site nucleophilicity cannot be achieved by the knowledge of the atom donor set for zinc only, as currently done in the literature. Moreover, we show that sulfur proton affinity and activation barrier are directly proportional, thus providing a good nucleophilicity index for zinc-bound thiolate.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

Nous avons étudié la réactivité nucléophile de complexes biomimétiques du zinc, incluant le motif Zn-thiolate, vis-à-vis de l'iodure de méthyle. La barrière d'activation a été calculée en utilisant la fonctionnelle de la densité B3LYP. Les facteurs influençant la réactivité (charge totale, nature des ligands du métal, liaisons hydrogène) montrent que la seule connaissance des atomes liés au zinc, comme souvent fait dans la littérature, ne permet pas de comprendre la nucléophilie du site. De plus, l'affinité protonique du soufre corrèle avec la barrière d'activation, fournissant ainsi un indice de nucléophilie performant pour le motif zinc–thiolate.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Density functional calculations, Zinc, Nucleophilicity, Hydrogen bonds, S ligands, Tridentate ligands, Bioinorganic chemistry

Mots-clés : Calculs DFT, Zinc, Nucléophilie, Liaisons hydrogène, Ligands S, Ligands tridentate, Chimie bioinorganique


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Vol 12 - N° 5

P. 546-553 - mai 2009 Retour au numéro
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