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New insights in protein phosphorylation: a signature for protein phosphatase 1 interacting proteins - 01/01/04

Doi : 10.1016/j.crvi.2004.01.001 

Alphonse  Garcia a * ,  Xavier  Cayla b ,  Bernard  Caudron c ,  Éric  Deveaud c ,  Fernando  Roncal d ,  Angelita  Rebollo e *Corresponding author.

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Résumé

Protein phosphatase 1 is regulated by the interaction between a catalytic subunit (PP1c) and multiple interacting proteins that allow the specific dephosphorylation of diverse cellular targets. This communication proposes to use the simultaneous presence of distinct consensus PP1c docking motifs R/K-x(0,1)-V-x-F and F-x-x-R/K-x-R/K as a signature to identify proteins putatively interacting with the PP1c. To develop this concept, we propose a new website, http://pp1signature.pasteur.fr, which allows the identification of putative PP1-interacting proteins containing the two distinct PP1c docking consensus motifs represented in the Swissprot library. To validate the new concept of signature, we were able to characterise, by co-immunoprecipitation, four new PP1c interacting proteins randomly selected from the database in our website. To cite this article: A. Garcia et al., C. R. Biologies 327 (2004).

Résumé

La famille des protéines phosphatases 1 est constituée de nombreuses holoenzymes différentes, résultant de l'interaction d'une sous-unité catalytique (PP1c) avec des sous-unités qui régulent son activité. Cette communication propose d'utiliser la présence de deux motifs consensus R/K-x(0,1)-V-x-F et F-x-x-R/K-x-R/K, déduits des sites d'interaction de certaines protéines Bcl-2 avec PP1c, pour identifier de nouvelles protéines interagissant avec PP1c. Pour développer ce concept, nous avons créé le site web http://pp1signature.pasteur.fr. Cet outil bio-informatique permet d'identifier, à partir des séquences protéiques présentes dans la banque Swissprot, des protéines potentiellement capables d'interagir avec PP1c. Pour valider ce concept, nous avons sélectionné à partir de notre site web et caractérisé par co-immunoprécipitation quatre nouvelles protéines qui interagissent avec PP1c. Pour citer cet article : A. Garcia et al., C. R. Biologies 327 (2004).

Mots clés  : protein phosphatase 1 ; specific dephosphorylation ; Swissprot library ; signature ; co-immunoprecipitation.

Mots clés  : protéine phosphatase 1 ; déphosphorylation spécifique ; banque Swissprot ; signature ; co-immunoprécipitation.

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Vol 327 - N° 2

P. 93-97 - février 2004 Retour au numéro
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  • Contribution to the analysis of gaits: practical elements to complement the Hildebrand method
  • Sabine Renous, Marc Herbin, Jean-Pierre Gasc

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