Les Chlamydia sont des bactéries intracellulaires obligatoires responsables principalement d'infections sexuellement transmissibles (IST). Les réinfections ou les infections chroniques provoquent des inflammations à l'origine de complications telles que l'hypofertilité. Ces inflammations sont le résultat d'une stimulation immune continue. La prévalence élevée des infections à Chlamydia reflète la longue persistance de ces micro-organismes chez leur hôte. Les infections sont très souvent asymptomatiques et constituent un risque important de complications et de transmission. Le diagnostic direct d'une infection aiguë à Chlamydia trachomatis est réalisé par la mise en évidence de la bactérie vivante par culture cellulaire, de ses antigènes par immunofluorescence directe (IFD) ou par les techniques immunoenzymatiques et apparentées, de ses acides nucléiques par hybridation moléculaire ou par amplification génique (amplification d'un gène chromosomique, amplification d'une courte séquence du plasmide ou de l'ARNr). Au cours d'une infection chronique ou persistante, la charge bactérienne est faible et les bactéries sont très souvent non cultivables et expriment des antigènes différents. La culture cellulaire et les techniques habituelles de mise en évidence des antigènes peuvent être négatives, ce qui implique l'utilisation des techniques de détection des acides nucléiques avec amplification associée à un diagnostic sérologique. L'utilisation des techniques d'amplification a considérablement amélioré le diagnostic direct des infections à Chlamydia et offre, en outre, l'opportunité d'utiliser des prélèvements non invasifs pour le dépistage des sujets asymptomatiques. Nous proposons la meilleure stratégie diagnostique en fonction du contexte clinique.

Chlamydiae are obligate intracellular bacteria. Chlamydia trachomatis is the most common sexually transmitted disease (STD). The C. trachomatis damaging disease sequelae such as sterility is based on intense and chronic inflammation elicited and maintained by reinfection or persistent infection. The high prevalence of C. trachomatis infection reflects the long and successful adaptation of these organisms to persist in their human host population. The large group of asymptomatically infected persons is not only at risk of serious long-term sequelae but also sustains transmission within communities. C. trachomatis acute infections have been diagnosed by cell culture, direct immunofluorescence, enzyme immunoassay, direct DNA hybridization, and more recently by nucleic acid amplification tests (NAATs). In chronic or persistent chlamydial infections, the level of Chlamydia is very low and bacteria are often not viable. Such infections would be characterized by continuing positive NAATs but only intermittent isolation of viable Chlamydia and positive assays for chlamydial protein antigen. The development of NAATs has been a major advance in the field of chlamydial diagnosis. The use of NAATs associated with serology test is the best diagnosis. The introduction of assays based on amplification of genetic material has subsequently increased the sensitivity of detecting chlamydial infections and offers the opportunity to use non-invasive sampling techniques to screen for infections in asymptomatic subjects. In this article, it was proposed the best diagnosis approaches for detection of acute and chronic infections.