La microsporidiose et la cryptosporidiose sont deux parasitoses opportunistes émergentes responsables de manifestations intestinales souvent sévères chez les patients immunodéprimés. Nous rapportons un cas de co-infection microsporidiose-cryptosporidiose chez un nouveau-né infecté par le virus d’immunodéficience humaine (VIH). Il s’agissait d’un nouveau-né de sexe féminin, âgé de 17 jours, alimenté exclusivement au lait maternel et sans contacts avec les animaux. Le diagnostic de microsporidiose et de cryptosporidiose a été porté par des recherches systématiques dans les selles aussi bien par des colorations spécifiques que par PCR (polymerase chain reaction). Deux espèces de microsporidies, Enterocytozoon bieneusi et Encephalitozoon intestinalis, et Cryptosporidium hominis ont été identifiés. La contamination de ce nouveau-né était probablement interhumaine directe par contact intime avec sa mère qui présentait une diarrhée (elle avait refusé les prélèvements des selles). Cette observation témoigne de l’intérêt du dépistage des microsporidies et des cryptosporidies intestinales chez les sujets infectés par le VIH en vue d’une meilleure prise en charge.

Microsporidiosis and cryptosporidiosis are emerging opportunistic infections responsible for intestinal manifestations that are often severe in immunocompromised patients. A case of microsporidiosis-cryptosporidiosis coinfection is reported in an HIV-infected newborn. The patient was a 17-day-old female, exclusively breastfed and with no contact with animals. Microsporidiosis and cryptosporidiosis were diagnosed after systematic screening in stool samples using both specific staining and PCR. Two species of microsporidia, Encephalitozoon intestinalis and Enterocytozoon bieneusi, and Cryptosporidium hominis were identified. The contamination of the newborn probably resulted from direct human-to-human transmission during close contact with the mother (who had diarrhea and refused stool sampling). This report highlights the usefulness of the screening of intestinal microsporidiosis and cryptosporidiosis in HIV-infected subjects for better management.