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Phylogenetic identification of Nocardia brasiliensis strains isolated from actinomycetoma in Mexico State using species-specific primers - 14/06/11

Doi : 10.1016/j.mycmed.2011.04.001 
A. Ramírez-Radilla a, V. Rodríguez-Nava b, H.V. Silva-Rojas c, M. Hernández-Tellez d, H. Sandoval e, N. Ramírez-Durán a,
a Laboratorio de Microbiología Médica y Ambiental, Facultad de Medicina, Universidad Autónoma del Estado de México, Paseo Tollocan y Jesús Carranza s/n Colonia Moderna de la Cruz, Toluca, C.P. 50180 Mexico 
b UMR CNRS 5557, Center for Microbial Ecology, French Observatory of Nocardiosis, School of Pharmacy, University Claude-Bernard, Lyon 1, France 
c Colegio de Posgraduados, Campus Montecillo, Km 36.5 Carretera México-Texcoco, Montecillo Estado de México, C.P. 56230 Mexico 
d Laboratorio de Hidrogeomática, Centro Interamericano de Recursos del Agua, Universidad Autónoma del Estado de México, Carretera Toluca-Atlacomulco, Km 14.5, Toluca, Estado de México, C.P. 50200 Mexico 
e Laboratorio de Producción de Biológicos, Universidad Autónoma Metropolitana-Xochimilco. Calzada del Hueso 1100, Colonia Villa Quietud, Coyoacán D.F. C.P. 04960 Mexico 

Corresponding author.

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Summary

Objective

The aim of our research was to update the situation concerning actinomycetoma in Mexico, to localize areas where it is frequently found and to identify the main strains from the isolates.

Material and methods

To localize cases of actinomycetoma, patients’ medical records from the dermatology departments of general and private hospitals were reviewed. Pathologic strains were looked for in general hospital patients and in reference institutes in Mexico City. The clinical strains were kept in Bennett agar and were subsequently identified using polyphasic approaches, including a partial sequence of 16S rDNA using species-specific primers designed to recognise Nocardia species.

Results

Eleven cases of actinomycetoma and five species of pathological strains were identified. Most cases were found in south-eastern Mexico and Nocardia brasiliensis was the most frequently isolated species.

Conclusions

This research confirmed the presence of actinomycetoma in Mexico as well as the zones of high incidence and the most frequent pathological strain.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

Objectif

L’objectif de notre recherche était de connaître la situation actuelle des actinomycétomes au Mexique, identifier dans quelles régions du Mexique la maladie est plus fréquente et déterminer l’espèce dominante isolée dans les cas trouvés.

Matériel et méthodes

Pour répertorier les cas d’actinomycétome, nous avons revu les dossiers des services de dermatologie des hôpitaux publics et privés du Mexique. Nous avons fait aussi une recherche des souches cliniques dans les hôpitaux généraux et instituts de référence de la ville de Mexico. Les souches cliniques ont été maintenues sur agar Bennett et identifiées par une approche polyphasique y compris l’étude d’une séquence de l’ADNr 16S en utilisant des amorces spécifiques d’espèce pour les Nocardia.

Résultats

Cette recherche a permis de trouver 11 cas d’actinomycétome, dont nous avons obtenu cinq souches cliniques qui ont été identifiées au niveau de l’espèce. La plupart des cas d’actinomycétome ont été trouvés dans la région sud-est du Mexique. L’espèce isolée dans ces cas a été identifiée à Nocardia brasiliensis.

Conclusion

Cette recherche confirme la présence de cas d’actinomycétome au Mexique dans des régions de majeure incidence et montre que Nocardia brasiliensis est l’espèce dominante dans les cas trouvés.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Actinomycetoma, Mexico, 16S rRNA identification, Characterization phenotypic, Nocardia brasiliensis

Mots clés : Actinomycétomes, Mexique, Identification par l’ARNr 16S, Caractérisation phénotypique, Nocardia brasiliensis


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Vol 21 - N° 2

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