Bien que largement utilisées tant en prévention qu'en curatif, les applications des héparines ont été renouvelées par l'introduction des héparines de bas poids moléculaire (HBPM). Ces dernières ont une durée de vie plus longue, une meilleure biodisponibilité et entraînent moins de risque de thrombopénie grave avec thrombose. Cependant, éliminées en partie par voie rénale, elles peuvent s'accumuler lors d'insuffisance rénale. De nombreux essais cliniques ont montré l'efficacité thérapeutique de ces molécules avec, pour les HBPM, un risque hémorragique sans doute réduit. Le suivi thérapeutique est également plus simple et le dosage d'héparinémie anti-Xa sans doute réellement utile seulement pour des patients particuliers : poids très anormal, insuffisance rénale. En revanche, le risque de thrombopénie, même plus faible, nécessite le suivi plaquettaire. Le risque d'ostéoporose est également plus faible avec les HBPM, mais reste suffisant pour éviter les traitements prolongés coûteux sauf chez de rares patients ayant, par exemple, une contre-indication aux antivitamines K.

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