L'incidence des infections fongiques invasives a considérablement augmenté au cours de ces 20 dernières années. Cette augmentation est corrélée avec le développement de nouvelles thérapeutiques (chimiothérapie anticancéreuse, interventions chirurgicales lourdes, transplantations d'organes, greffes de moelle osseuse). Les techniques de typage moléculaire constituent un outil précieux pour l'étude de ces infections. Elles permettent d'identifier les souches d'organismes pathogènes et peuvent s'avérer utiles dans la détection de sources d'infections nosocomiales ou dans la détermination des relations épidémiologiques entre isolats.

De plus, une meilleure compréhension du cycle, du mode de reproduction ou encore de la différenciation génétique entre champignons pathogènes permet de mieux appréhender leur comportement au sein de leur habitat naturel. Sur le plan de la taxonomie, le typage moléculaire a permis d'apporter de nouvelles données sur l'identification et la classification des champignons impliqués en pathologie humaine.

Dans cette revue, les auteurs énoncent les principes et les applications des techniques de typage les plus couramment utilisées dans la littérature et discutent de leur utilité en tant qu'outils performants dans les études de mycologie moléculaire.

The incidence of invasive fungal infections had risen dramatically during the past 2 decades. This phenomenon was due to recent advances in medical and surgical therapies (i.e. intensive anticancer therapy, aggressive surgical interventions, organ and bone marrow transplantations). Molecular typing methods are useful tools in molecular mycology. They may help to identify pathogenic strains, for detecting sources of nosocomial infections and for determining their epidemiological relationship.

Moreover, a better understanding of life cycle, mode of reproduction and genetic differentiation of fungi should provide better knowledge of their behavior in the natural habitat. Concerning the taxonomy, molecular typing has brought new data for the classification and identification of medically important fungal species.

In this review of literature, various commonly used typing methods are described and their usefulness as powerful tools in molecular mycology studies are discussed.