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Molecular characterization of environmental Cryptococcus neoformans VNII isolates in Jos, Plateau State, Nigeria - 05/12/16

Doi : 10.1016/j.mycmed.2016.04.001 
N.E. Nnadi a, I.B. Enweani b, M. Cogliati c, , G.M. Ayanbimpe d, M.O. Okolo d, E. Kim d, M.Z. Sabitu e, G. Criseo f, O. Romeo f, g, F. Scordino g
a Department of Microbiology, Plateau State University, P.M.B 2012, Bokkos, Plateau State, Nigeria 
b Department of Medical Laboratory Science, Nnamdi Azikiwe University, Nnewi Campus, Nigeria 
c Massimo Cogliati, Lab. Micologia Medica, Dipartimento di Scienze Biomediche per la Salute, Università degli Studi di Milano, Via Pascal 36, 20133 Milano, Italy 
d Department of Medical Microbiology, University of Jos, Jos, Nigeria 
e Department of Medical Microbiology, Jos University Teaching Hospital, Jos, Nigeria 
f Department of Chemical, Biological, Pharmaceutical and Environmental Sciences, University of Messina, Messina, Italy 
g IRCCS Centro Neurolesi “Bonino-Pulejo”, Messina, Italy 

Corresponding author.

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Summary

Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii are encapsulated yeasts able to cause fatal neurological infections in both human and other mammals. Cryptococcosis is the most common fungal infection of the central nervous system and has a huge burden in sub-Saharan Africa and South East Asia. Bird excreta are considered an environmental reservoir for C. neoformans in urban areas, therefore a study aimed at isolating and characterizing this yeast is important in disease management. In this study, one hundred samples of pigeon droppings were collected in Jos, Plateau State, Nigeria. C. neoformans was isolated from three samples and initially identified using standard phenotypic and biochemical tests. Molecular analysis revealed that all three isolates belonged to C. neoformans genotype VNII, mating type α and were assigned to the sequence type ST43 by multilocus sequence typing analysis. This study reports, for the first time, the molecular characterization of C. neoformans in Nigeria, where little is still known about the environmental distribution of the genotypes, serotypes and mating types of this important human pathogen.

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Résumé

Cryptococcus neoformans et Cryptococcus gattii sont des levures encapsulées capables de causer des infections neurologiques mortelles chez l’homme et d’autres mammifères. La cryptococcose est l’infection fongique la plus commune du système nerveux central avec une incidence élevée en Afrique subsaharienne et en Asie du Sud-Est. Les excréments d’oiseaux sont considérés comme le réservoir environnemental pour C. neoformans dans les zones urbaines ; par conséquent, une étude visant à isoler et caractériser cette levure est utile pour la prise en charge de la maladie. Dans cette étude, une centaine d’échantillons de fientes de pigeons a été recueillie à Jos, Plateau State, au Nigeria. C. neoformans a été isolé à partir de trois échantillons et initialement identifiés à l’aide de tests phénotypique et biochimiques. L’analyse moléculaire, par multilocus sequence typing, a révélé que les trois souches appartenaient au type moléculaire VNII, mating type α et au génotype ST43 par analyse multilocus sequence typing. Cette étude rend compte, pour la première fois au Nigeria, de la caractérisation moléculaire de souches environnementales de C. neoformans, où peu est encore connu à propos de la diffusion dans l’environnement des génotypes, sérotypes et mating types de cet important pathogène humain.

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Keywords : Cryptococcus neoformans, Nigeria, Environment, Mating types, Molecular types

Mots clés : Cryptococcus neoformans, Nigeria, Environnement, Mating types, Molecular types


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Vol 26 - N° 4

P. 306-311 - décembre 2016 Regresar al número
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