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Interactions entre le microbiote fongique et bactérien intestinal au cours des formes familiales de maladie de Crohn - 16/09/17

Doi : 10.1016/j.mycmed.2017.04.032 
Gautier Hoarau 1, 9, Pranab Mukherjee 2, Corinne Gower-Rousseau 3, Chris Hager 2, Jyostna Chandra 2, Maurizio Retuerto 2, Christel Neut 4, Sandrine Vermeire 5, Jose Clemente 6, Jean-Frederic Colombel 7, Hisashi Fujioka 8, Daniel Poulain 1, Mahmoud Ghannoum 2, Boualem Sendid 1,
1 Inserm U995-Team 2, pôle recherche, faculté de médecine H.-Warembourg, université du droit et de la santé – Lille II, université Lille 2, CHRU de Lille, France 
2 Center for Medical Mycology, University Hospitals Case Medical Center, Case Western Reserve University, Cleveland, Ohio, États-Unis 
3 Epimad Registry, Epidemiology Unit and LIRIC Inserm 995, Lille University and Hospital, université Lille II – droit et santé, Lille, France 
4 Inserm U995-Team 2, pôle recherche, faculté de médecine H.-Warembourg, université Lille 2, CHRU de Lille, Lille, France 
5 Department of Gastroenterology, University Hospital Leuven, Leuven, Belgique 
6 Department of Genetics and Genomic Sciences, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, Immunology Institute, New York, NY, États-Unis 
7 Department of Gastroenterology, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, NY, États-Unis 
8 EM Core Facility, School of Medicine, Case Western Reserve University, Cleveland, Ohio, États-Unis 

Auteur correspondant.

Resumen

Introduction

La maladie de Crohn (MC), est une maladie inflammatoire chronique intestinale, d’origine multifactorielle, impliquant potentiellement une dérégulation de la réaction immunitaire muqueuse vis-à-vis d’un microbiote intestinal déséquilibré sous l’influence de facteurs environnementaux et génétiques. L’objectif de notre travail était de caractériser le microbiote fongique, conjointement au microbiote bactérien au cours de formes familiales de MC.

Méthodes

Nous avons utilisé une plateforme de séquençage à haut débit (Ion torrent PGM) pour caractériser le microbiote fécal (fongique et bactérien), échantillonné dans 9 familles multiplexes atteints de MC (20 patients, et 28 parents sains de premier degré), et 4 familles contrôles (21 individus sains non apparentés). Une étude bioinformatique a été réalisée pour analyser l’abondance, la biodiversité, et les interactions microbiennes.

Résultats

Le microbiote fécal des membres issus des familles multiplexes était statistiquement différent de celui des membres issus des familles contrôles. L’analyse en composante principale a montré qu’au sein des familles multiplexes, les patients MC et sujets sains apparentés partageaient un répertoire fongique commun. Les patients MC avaient en revanche un microbiote enrichi en Candida tropicalis, Escherichia coli et en Serratia marcescens, et appauvri en bactéries bénéfiques (Faecalibacterium prausnitzii). De plus les taux d’ASCA (anticorps anti-S. cerevisiae), marqueur sérologique de la MC étaient corrélés à la présence de C. tropicalis (p=0,01). Enfin, nous avons mis en évidence une synergie entre C. tropicalis, E. coli et S. marcescens, suggérant une interaction microbienne in vivo pouvant participer à l’aggravation de l’inflammation intestinale. Ces données ont été validées par la suite in vitro avec un modèle de biofilm impliquant ces trois espèces.

Conclusion

Dans ces formes familiales de MC, la dysbiose et les interactions microbiennes entre bactéries et champignons pourraient contribuer à l’aggravation de la réponse inflammatoire au cours de la maladie.

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Vol 27 - N° 3

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  • Le P17, un nouveau peptide antimicrobien, favorise l’activité antifongique des macrophages via l’induction des récepteurs Mannose et Dectine-1 et contribue à la résolution d’une candidose digestive expérimentale
  • Khaddouj Benmoussa, Hélène Authier, Mélissa Prat, Mohammad Alaeddine, Lise Lefèvre, Mouna Chirine Rahabi, José Bernad, Elsa Bonnafé, Jérôme Leprince, Bernard Pipy, Michel Treilhou, Agnès Coste

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