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Primo-infection à Pneumocystis jirovecii et diversité génotypique - 16/09/17

Doi : 10.1016/j.mycmed.2017.04.038 
Thibaud Guillaud-Saumur 1, Solene Le Gal 1, 2, 8, , Pierrick Cros 3, Michèle Virmaux 1, Sophie Vallet 4, 5, Laurence Pougnet 1, Anne Totet 6, 7, Loïc De Parscau 3, Gilles Nevez 1, 2
1 Groupe d’étude des interactions hôte-pathogène (GEIHP), université de Bretagne Occidentale [UBO] : EA3142, université de Bretagne-Loire, 22, avenue Camille-Desmoulins, 29238 Brest cedex, France 
2 Laboratoire de parasitologie et mycologie, CHU de Brest, boulevard Tanguy-Prigent, 29609 Brest cedex, France 
3 Service de pédiatrie et génétique médicale, CHU de Brest, avenue Foch, 29609 Brest cedex, France 
4 Laboratoire de virologie, CHU de Brest, boulevard Tanguy-Prigent, 29609 Brest cedex, France 
5 Inserm, « génétique, génomique fonctionnelle et biotechnologie », université de Bretagne Occidentale (UBO), université de Bretagne-Loire, France 
6 Laboratoire de parasitologie et mycologie, CHU d’Amiens, 80054 Amiens cedex 1, France 
7 UMR-I 01, unité mixte de recherche INERIS périnatalité et risques toxiques, université de Picardie Jules-Verne, Amiens, France 

Auteur correspondant.

Resumen

La primo-infection à Pneumocystis jirovecii (P. jirovecii) survient avec une incidence élevée chez le nourrisson sans déficit immunitaire pendant les deux premières années de vie. Néanmoins, les données sur les caractéristiques génotypiques de P. jirovecii dans cette population de patients demeurent parcellaires. Dans ce contexte, l’objectif de ce travail a été d’identifier les génotypes multilocus (MLG) de P. jirovecii chez 26 nourrissons immunocompétents développant une primo-infection. Ces génotypes ont été comparés à ceux identifiés de façon contemporaine chez 10 patients adultes immunodéprimés développant une pneumonie à Pneumocystis (PPC), ces deux populations étant suivies au sein du CHRU de Brest. Des extraits d’ADN de P. jirovecii provenant de ces deux populations ont été amplifiés puis séquencés sur 3 loci, le gène codant pour l’ARN de la grande sous-unité du ribosome de la mitochondrie (mtLSU rRNA), le cytochrome b (CYB) et la superoxyde dismutase (SOD). Les séquences obtenues ont été alignées et comparées aux séquences de référence.

Dix-sept MLG différents ont été identifiés ; 9 chez les enfants développant une primo-infection et 8 chez les adultes développant une PPC. Le génotypage multilocus a permis de répartir les patients en deux groupes selon leur âge et la présentation clinique. En effet aucun des MLG identifiés dans un des 2 groupes n’a été identifié dans l’autre groupe.

Ces résultats suggèrent que :

– les enfants et les adultes sont infectés par des souches de P. jirovecii différentes ;

– les cycles d’acquisition et de transmission de P. jirovecii dans ces deux populations pourraient être indépendants.

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Vol 27 - N° 3

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