Las malformaciones del tubo digestivo son, en frecuencia, el tercer grupo de anomalías después de las malformaciones renales y del sistema nervioso central. Su incidencia se estima en uno de cada 3.000-4.000 nacimientos. En la gran mayoría de los casos, se caracterizan por síntomas obstructivos en el período pre y posnatal. Su tratamiento es quirúrgico, con carácter más o menos urgente según la etiología y el nivel de la obstrucción. Algunas ocurren muy temprano en el desarrollo, por lo que reciben la denominación de embriopatías (antes de las 10 semanas de amenorrea [SA]). Pueden ir acompañadas entonces de un cortejo de otras malformaciones locales o generales que deben detectarse. Otras se forman más tarde en el embarazo y corresponden a fetopatías (más allá de las 10 SA). Al nacer, aparte de la exploración física inicial, la radiografía toracoabdominal permite orientar la continuación de las exploraciones radiológicas antes de decidir la estrategia quirúrgica. Las malformaciones cólicas (atresia cólica, duplicación cólica, malformaciones anorrectales, enfermedad de Hirschsprung, seudoobstrucción intestinal crónica) no se tratan en este artículo y se desarrollan en artículos específicos de la EMC.