Dans les bases de données, les séquences de référence des gènes impliqués dans l’expression des antigènes érythrocytaires sont souvent erronées. Du design des tests jusqu’à l’interprétation des variants rares, ces erreurs peuvent avoir des conséquences en diagnostic. Récemment, une approche par PCR « long-range » couplée au séquençage de nouvelle génération de fragments courts a été utilisée pour redéfinir la séquence de référence du gène RHD (système Rh) chez des individus hémizygotes (une copie de RHD). Dans un génome « normal », deux copies des autres gènes sont généralement présentes et cette dernière approche est donc irréalisable en raison des difficultés de phasage liées à la distance entre les marqueurs hétérozygotes. Pour contourner cette limite, nous avons utilisé une technologie de séquençage de longs fragments et testé notre approche sur le gène ACKR1 (2,5kb; système Duffy). Le locus ACKR1 de 65 échantillons de génotype connu, soit 130 allèles, a été amplifié par PCR « long-range ». Après multiplexage des amplicons et séquençage (Sequel, PacBio), les séquences des trois allèles majoritaires ACKR1*01, *02 et *02N.01 ont été obtenues. De manière importante, les deux premiers allèles sont caractérisés par des combinaisons variables de marqueurs polymorphes dans les régions non-codantes dont il convient de tenir compte pour l’élaboration d’outils diagnostiques. Parallèlement à ce travail, d’autres expériences ont été menées avec succès sur les gènes KEL (21,3kb), ART4 (18,0kb) et SLC14A1 (28,3kb) (systèmes Kell, Dombrock et Kidd, respectivement), suggérant que notre stratégie est particulièrement adaptée pour redéfinir les séquences cibles à haute résolution.