Suscribirse

Systemic screening identifies GABRD, a subunit gene of GABAA receptor as a prognostic marker in adult IDH wild-type diffuse low-grade glioma - 18/09/19

Doi : 10.1016/j.biopha.2019.109215 
Hongwei Zhang a, 1, Lixia Zhang b, 1, Yumin Tang a, Chaoji Wang a, Yiding Chen a, Jinjun Shu a, Kexian Zhang a,
a Department of Anesthesiology, Sichuan Cancer Hospital and Institute, Sichuan Cancer Center, School of Medicine, University of Electronic Science and Technology of China, Chengdu, Sichuan, 610041, China 
b Department of Hepatobiliary and Pancreatic Surgery, Sichuan Cancer Hospital and Institute, Sichuan Cancer Center, School of Medicine, University of Electronic Science and Technology of China, Chengdu, Sichuan, 610041, China 

Corresponding author.

Bienvenido a EM-consulte, la referencia de los profesionales de la salud.
El acceso al texto completo de este artículo requiere una suscripción.

páginas 8
Iconografías 7
Vídeos 0
Otros 0

Abstract

Currently, no reliable prognostic biomarkers have been identified for adult IDH wild-type (WT) diffuse low grade glioma (LGG). With data from The Cancer Genome Atlas (TCGA)-LGG, we examined the prognostic value of GABAA receptor subunits in adult IDH WT LGG. Using 2016 WHO CNS tumor classification, we re-classified the TCGA-LGG and identified 95 IDH WT patients. Among 16 GABAA receptor subunit genes with RNA-seq data, eight genes showed significantly different expression in IDH WT LGG compared with IDH mutant (MT) cases. Among these genes, only GABRD expression was related to overall survival (OS) status. Preserved GABRD expression was independently associated with longer OS (HR: 0.799, 95%CI: 0.691-0.925, p = 0.003) in IDH WT LGG. GABRD expression showed a moderately negative correlation with tumor infiltration macrophage (TIM) and CSF1 expression. The methylation status of 34 CpG sites across GABRD gene was checked and only cg13916816 showed a moderately negative correlation with GABRD expression. In conclusion, GABRD expression might serve as a potential independent prognostic marker in patients with IDH WT LGG. Meanwhile, its expression was negatively correlated with the extent of TIM, which might help to explain the favorable survival outcome. Cg13916816 might be a critical CpG site influencing GABRD expression in IDH WT LGG.

El texto completo de este artículo está disponible en PDF.

Keywords : IDH mutation, Low grade glioma, Prognosis, GABRD


Esquema


© 2019  The Authors. Publicado por Elsevier Masson SAS. Todos los derechos reservados.
Añadir a mi biblioteca Eliminar de mi biblioteca Imprimir
Exportación

    Exportación citas

  • Fichero

  • Contenido

Vol 118

Artículo 109215- octobre 2019 Regresar al número
Artículo precedente Artículo precedente
  • Ardisia crispa root hexane fraction suppressed angiogenesis in human umbilical vein endothelial cells (HUVECs) and in vivo zebrafish embryo model
  • Lim Wen Jun, Chan Pit Foong, Roslida Abd Hamid
| Artículo siguiente Artículo siguiente
  • A Malva parviflora´s fraction prevents the deleterious effects resulting from neuroinflammation
  • Cristina E. Ramírez-Serrano, Enrique Jiménez-Ferrer, Maribel Herrera-Ruiz, Alejandro Zamilpa, Gabriela Vargas-Villa, Ricardo Jair Ramírez-Carreto, Anahí Chavarría, Jaime Tortoriello, Gustavo Pedraza-Alva, Leonor Pérez-Martínez

Bienvenido a EM-consulte, la referencia de los profesionales de la salud.
El acceso al texto completo de este artículo requiere una suscripción.

Bienvenido a EM-consulte, la referencia de los profesionales de la salud.
La compra de artículos no está disponible en este momento.

¿Ya suscrito a @@106933@@ revista ?

Mi cuenta


Declaración CNIL

EM-CONSULTE.COM se declara a la CNIL, la declaración N º 1286925.

En virtud de la Ley N º 78-17 del 6 de enero de 1978, relativa a las computadoras, archivos y libertades, usted tiene el derecho de oposición (art.26 de la ley), el acceso (art.34 a 38 Ley), y correcta (artículo 36 de la ley) los datos que le conciernen. Por lo tanto, usted puede pedir que se corrija, complementado, clarificado, actualizado o suprimido información sobre usted que son inexactos, incompletos, engañosos, obsoletos o cuya recogida o de conservación o uso está prohibido.
La información personal sobre los visitantes de nuestro sitio, incluyendo su identidad, son confidenciales.
El jefe del sitio en el honor se compromete a respetar la confidencialidad de los requisitos legales aplicables en Francia y no de revelar dicha información a terceros.


Todo el contenido en este sitio: Copyright © 2024 Elsevier, sus licenciantes y colaboradores. Se reservan todos los derechos, incluidos los de minería de texto y datos, entrenamiento de IA y tecnologías similares. Para todo el contenido de acceso abierto, se aplican los términos de licencia de Creative Commons.