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Estimation of genetic variation in the Secretor and Lewis genes in Iranian hospitalized children - 31/01/21

Doi : 10.1016/j.tracli.2020.12.001 
Mohammad Farahmand a, Somayeh Jalilvand a, , Arash Arashkia b, Anahita Izadi c, Seyed Mohammad Forouzannia d, Yaghoub Mollaei-Kandelous e, Zabihollah Shoja b,
a Department of Virology, School of Public Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran 
b Department of Molecular Virology, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran 
c Department of Pediatric Infectious diseases, Bahrami Children Hospital, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran 
d School of Medicine, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran 
e Department of Immunology, School of Medicine, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran 

Corresponding authors.

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Abstract

Background

The Secretor (FUT2) and lewis gene (FUT3) are in charge of the construction of histo-blood group antigens, which act as a receptor for some Pathogenes. This study aimed to estimate the prevalence of five significant single nucleotide polymorphisms (SNPs) in Iranian children.

Methods

In this cross-sectional study, 102 blood samples collected from hospitalized children. The FUT2 gene region was amplified and sequenced to explore rs1047781 and rs601338, and the FUT3 gene region was amplified to explore rs28362459, rs812936, rs778986 SNPs.

Results

In FUT2 gene, Se358,428 that produces Se phenotype with 63% (0.53 - 0.72) prevalence, was the most common genotype. For FUT3 gene Le59,202,314 with 80% prevalence was most common genotype (0.71 - 0.87).

Conclusion

This study genotyped Secretor and Lewis genes and designated SNPs’ distinct distribution in Iran, and clarified at-risk groups for certain diseases.

El texto completo de este artículo está disponible en PDF.

Keywords : FUT2 gene, FUT3 gene, Secretor status, Lewis Status, Histo-blood group antigens (HBGAs)


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Vol 28 - N° 1

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