Les complications de l'endoscopie digestive peuvent être liées à l'anesthésie, à l'endoscopie elle-même ou au geste thérapeutique éventuellement associé. Les complications liées à la sédation sont cardiorespiratoires et représentent 50 % de la morbidité. Les comorbidités du patient doivent être connues si l'on veut les prévenir. Celles en rapport avec la procédure sont principalement les hémorragies et les perforations. Les progrès récents ont permis de nouvelles indications thérapeutiques dont les complications sont plus spécifiques. La prévention de ces complications repose d'abord sur la pertinence des indications qui ne se conçoivent que dans une évaluation bénéfice/risque pour chaque patient, mais aussi sur la réalisation des examens dans un environnement adapté, par un endoscopiste expérimenté.