Le concept de colite microscopique regroupe les diarrhées chroniques sans anomalie macroscopique du côlon, principalement caractérisées par la présence d'une bande collagène sous-épithéliale ou d'une augmentation des lymphocytes intraépithéliaux. Il s'agit d'affections rares, touchant plus souvent la femme d'âge mûr. Elles sont fréquemment associées à des manifestations rhumatologiques ou à des maladies auto-immunes variées, et pourraient être induites par certains médicaments. La physiopathologie ferait intervenir un agent extérieur responsable de lésions initiales discrètes, mais suivies d'une hyperactivation immunitaire à l'origine des lésions chroniques. Le retentissement clinique est souvent inconfortable mais généralement bénin. Le diagnostic nécessite des biopsies coliques étagées. Divers médicaments semblent avoir une certaine efficacité, qui s'avère souvent transitoire.

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