Il est rare que la possibilité de troubles fonctionnels digestifs divers, notamment de douleurs abdominales et de troubles du transit, ne soit pas mentionnée dans la notice des effets secondaires potentiels d'un médicament. Dans ce cadre très vaste, il est difficile de faire la part des plaintes psychogènes, des entéropathies fonctionnelles médicamenteuses, et des lésions organiques intestinales iatrogènes . Le diagnostic de ces dernières est souvent difficile. D'une part, en effet, le temps de prise médicamenteuse peut être trop bref (durée de prescription limitée ou arrêt par le malade du traitement du fait de la survenue d'un signe fonctionnel digestif) pour que les lésions organiques intestinales soient identifiables. D'autre part, la preuve directe de l'organicité des entéropathies médicamenteuses suppose la réalisation de biopsies intestinales, donc de gestes invasifs. Compte tenu de ces difficultés, la connaissance des entéropathies médicamenteuses est encore très imparfaite, et devrait faire l'objet d'efforts spécifiques de recherche dans les années à venir.

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