Las lesiones tumorales benignas y las lesiones seudotumorales (adenomiomas, lesiones regenerativas) de la ampolla de Vater constituyen una parte considerable de las lesiones ampulares que se diagnostican en la actualidad. Debido a su morbimortalidad, la duodenopancreatectomía cefálica debe reservarse, si es posible, para las lesiones malignas invasivas sin metástasis a distancia. Los datos que hacen pensar en una lesión benigna son: lesión no ulcerada en la duodenoscopia, ausencia de extensión a la muscular duodenal, al páncreas y/o a los ganglios linfáticos en la ecoendoscopia y ausencia de carcinoma invasivo en la biopsia. Algunos ecoendoscopistas también pueden confirmar que no existe extensión a la submucosa duodenal. Por tanto, la ampulectomía, que puede ser quirúrgica o endoscópica, está indicada en las lesiones ampulares benignas y en las malignas no invasivas. La ampulectomía quirúrgica, guiada por un estudio histológico intraoperatorio, es preferible a la ampulectomía endoscópica en los siguientes casos: lesión voluminosa (que, por esta vía, requeriría una fragmentación de la lesión que dificultaría la fiabilidad del análisis histológico), extensión ascendente por el conducto colédoco (observada en alrededor del 20% de los ampulomas), asociación a un divertículo yuxtaampular o recidiva tras ampulectomía endoscópica.