Al contrario del oído interno membranoso, que es de origen ectoblástico, el oído medio tiene un origen endoblástico y aparece al principio como un divertículo primitivo anterior, desarrollado a partir de la primera bolsa branquial. Este divertículo se interpone entre el oído interno y el oído externo, engloba a los huesecillos, que son de origen mesoblástico, y entra en contacto con el conducto auditivo externo para formar la membrana timpánica. De forma general, todas las estructuras del oído medio y las del oído externo derivan del aparato branquial, cuyo desarrollo se describirá de forma breve. Después se expondrá la formación de las cavidades y de las paredes del oído medio, de la cadena de los huesecillos y del tímpano, así como las principales malformaciones congénitas del oído medio. Por último, se hará hincapié en las aportaciones recientes de la genética en el estudio de los síndromes malformativos del oído medio.