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Epidemiology and molecular characterization of Cryptococcus neoformans isolated from pigeon excreta in Mazandaran province, northern Iran - 08/06/12

Doi : 10.1016/j.mycmed.2012.02.002 
S. Agha Kuchak Afshari, T. Shokohi , R. Aghili, H. Badali
Department of Medical Mycology and Parasitology, School of Medicine, Mazandaran University of Medical Sciences, Km 18 Khazarabad Road, P.O. Box 48175-1665, Sari, Iran 

Corresponding author.

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Summary

Objective

The aims of this study were to verify the presence of Cryptococcus neoformans in pigeon excreta in Mazandaran province, Iran, to identify the varieties of the C. neoformans isolates using D1/D2 and IGS sequencing, and determining the presence of the two mating types: ⍺ and a.

Materials and methods

Four hundred pigeon droppings samples were collected from 15 different cities in Mazandaran province over a period of 1 year (February 2010–March 2011). Identification of C. neoformans was determined based on growing brown colonies on Niger seed agar (NSA) and biochemical characteristics. We used MAT⍺ and MATa specific primers for determining mating type and sequence analysis of the D1/D2 and intergenic spacer regions were done.

Results

Out of 400 samples, 20 samples (5%) were positive for C. neoformans and all of these isolates were ⍺ mating types. Sequence analysis of polymerase chain reaction (PCR) amplicons of D1/D2 regions revealed that all of the isolates were C. neoformans var. grubii except two isolates that were C. neoformans var. neoformans.

Conclusion

Our results reinforced that the pigeon excreta is a favorable environment rich in nitrogen and supports the growth of C. neoformans and the pigeon could play an important role in spread of this organism.

El texto completo de este artículo está disponible en PDF.

Résumé

Objectif

Les objectifs de cette étude étaient de vérifier la présence de Cryptococcus neoformans dans les fientes de pigeons d’origine de la province de Mazandaran (Iran), afin d’identifier les variétés de C. neoformans isolées à l’aide des séquences D1/D2 et IGS et de déterminer la présence des deux types : ⍺ et a.

Matériels et méthodes

Les 400 échantillons d’excréments de pigeons ont été recueillis dans 15 villes différentes de la province de Mazandaran durant une période de plus d’un an (février 2010–mars 2011). L’identification de C. neoformans a été réalisée sur la base de la croissance de colonies brunes sur gélose à base de graines de Niger (NSA) et des caractéristiques biochimiques. Nous avons utilisé les amorces spécifiques MAT⍺ et MATa pour déterminer le type sexuel et analysé les séquences D1/D2 et inter-géniques.

Résultats

Sur les 400 échantillons, 20 échantillons (5 %) étaient positifs pour C. neoformans et l’ensemble de tous ces isolats étaient de type ⍺. Les séquences analysées par PCR des amplicons des régions D1/D2 ont révélé que tous les isolats étaient C. neoformans var. grubii sauf deux isolats qui étaient C. neoformans var. neoformans.

Conclusion

Nos résultats ont confirmé que les excréments de pigeon sont un environnement favorable riche en azote qui favorise la croissance de C. neoformans et que le pigeon joue un rôle important dans la propagation de cet organisme.

El texto completo de este artículo está disponible en PDF.

Keywords : Cryptococcus neoformans, Pigeon excreta, Epidemiology, Molecular characterization, Iran

Mots clés : Cryptococcus neoformans, Fientes de pigeon, Épidémiologie, Caractérisation moléculaire, Iran


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Vol 22 - N° 2

P. 160-166 - juin 2012 Regresar al número
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