Les manifestations hépatobiliaires des maladies inflammatoires chroniques des intestins (MICI) peuvent être classées en quatre groupes. Un premier groupe comporte celles qui sont liées par un mécanisme physiopathologique commun : la cholangite sclérosante primitive (CSP) atteinte inflammatoire et fibrosante de l'arbre biliaire. La CSP associée aux MICI n'a pas de particularité. Les MICI associées à la CSP ont un risque plus élevé de dysplasie et de cancer colique par rapport aux MICI sans CSP. La CSP peut se compliquer de cholangiocarcinome. La CSP peut être localisée uniquement aux voies biliaires intrahépatiques. L'overlap syndrome concerne des patients ayant des caractéristiques de la CSP et de l'hépatite auto-immune. La cholangite associée ou non à une élévation des immunoglobulines IgG4 fait partie d'une maladie systémique incluant le côlon. Le deuxième groupe comprend les complications hépatiques directes des MICI : la thrombose de la veine porte et les abcès du foie. Le troisième groupe comprend les complications indirectes des MICI : la stéatose secondaire à la dénutrition ou aux corticoïdes et la lithiase biliaire favorisée par l'atteinte iléale, et le quatrième groupe les atteintes hépatiques secondaires aux traitements des MICI : réactivation virale B en cas de portage de ce virus, lésions vasculaires endothéliales du foie et, en particulier hyperplasie nodulaire régénérative, et hépatites secondaires aux médicaments utilisés dans le traitement des MICI.