Les malformations du tractus génital sont liées à des anomalies de développement des canaux de Müller ; elles représentent environ 10 % des causes d'hypofertilité. Leur importance et leurs conséquences sont très variables, allant de la simple cloison vaginale révélée par une dyspareunie jusqu'à l'absence totale d'utérus entraînant une stérilité définitive. L'imagerie joue donc un rôle fondamental pour établir un diagnostic et un pronostic précis de la malformation. L'échographie vaginale est l'examen de première intention ; elle doit comporter systématiquement un temps sus-pubien ainsi qu'une étude de l'abdomen à la recherche d'une malformation rénale associée ; le mode 3D s'avère particulièrement utile dans cette indication, et permet le plus souvent d'aboutir au diagnostic. L'imagerie par résonance magnétique est actuellement la meilleure méthode d'imagerie en complément de l'échographie ; elle permet un bilan morphologique très précis de l'axe utérovaginal et supplante actuellement la cœlioscopie diagnostique. L'hystérographie n'est plus actuellement indiquée que dans le bilan d'infertilité pour visualiser les trompes. Enfin, et grâce à cette imagerie moderne, les méthodes endoscopiques (cœlioscopie, hystéroscopie) se placent actuellement au deuxième plan, surtout dans le but de réaliser des gestes thérapeutiques interventionnels.