Recent genome-wide association studies and replication analyses have reported the association of variants of the exostosin-2 (EXT2) gene and risk of type 2 diabetes mellitus (T2DM) in some populations, but not in others. This study investigated the associations of EXT2 variants rs1113132, rs3740878 and rs11037909 with T2DM in a Lebanese Arab population.

This case-control study involved 995 T2DM patients and 1076 control subjects. Genotyping was done by the allelic exclusion method.

While minor allele frequencies (MAFs) of rs11037909 (P=0.028) and rs3740878 (P=0.048), but not rs1113132 (P=0.841), were higher in patients, this was lost after correcting for multiple testing. Apart from EXT2 rs1113132, which was marginally associated with T2DM in the additive model (P=0.054), but not after adjustment for covariates, none of the tested EXT2 SNPs were associated with T2DM in any of the genetic models tested. However, variable associations of EXT2 variants with T2DM were noted according to BMI status. While the three tested EXT2 variants were not associated with T2DM in obese subjects, rs1113132 and rs11037909, but not rs3740878, were associated with T2DM in non-obese subjects. Meta-analysis revealed a significant association of rs11037909 and a marginal association of rs3740878 with T2DM in the fixed model. Using a common (GTA) haplotype as reference, three-locus (rs1113132/rs11037909/rs3740878) haplotype analysis demonstrated no association between any of the EXT2 haplotypes with T2DM, not even before correcting for multiple testing.

This study demonstrated no association of rs1113132, rs3740878 and rs11037909 EXT2 variants with T2DM.

Des études récentes du génome entier GWA et des analyses de réplication dans certaines populations ont rapporté une association significative entre les variants du gène exostine (EXT2) et le risque du diabète type 2 (DMT2). L’objectif de ce travail est d’évaluer dans la population arabe libanaise la contribution des variants rs1113132, rs3740878 et rs11037909 du gène EXT2 au risque du diabète type 2.

Cette étude cas-témoin porte sur 995 patients diabétiques de type 2 et 1076 sujets témoins. Le génotypage de ces polymorphismes est réalisé par la technique d’exclusion allélique.

Bien que nos résultats aient montré que les fréquences de l’allèle mineur (MAF) de rs11037909 (P=0,028) et rs3740878 (P=0,048), mais pas rs1113132 (P=0,841), sont significativement plus élevées chez les patientes par rapport aux sujets témoins, cette significativité a été perdue après l’application de la correction de Bonferroni pour de multiples tests. À part le variant rs1113132 du gêne EXT2, qui n’était que marginalement associé au DMT2 sous le modèle additif (P=0,054), et qui a perdu cette significativité après ajustement selon des covariables potentielles, aucun des autres single nucleotide polymorphisms (SNP) étudiés n’était associé au risque du DMT2 sous les différents modèles génétiques. L’association des variants du gène EXT2 au risque du DMT2 a été notée selon l’IMC. Cependant, les trois variants de l’EXT2 n’ont pas été associés avec diabète de type 2 chez les sujets obèses, en revanche seulement le rs3740878 a été associé au DMT2 chez les sujets non obèses. La méta-analyse a révélé une association significative du rs11037909 et une association marginale du rs3740878 de l’EXT2 avec le DMT2 sous le modèle génétique fixe. En prenant l’haplotype (GTA) comme référence (OR=1,00), l’analyse haplotypique de ces trois loci n’a révélé aucune association entre ces haplotypes et le risque du survenue de DMT2, avant même l’application de la correction pour de multiples tests.

Nous n’avons pas pu démontrer d’association entre les trois variants rs1113132, rs3740878 et rs11037909 du EXT2 avec le DMT2.