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Novel intein-containing DNA specific primers for rapid identification of Candida glabrata using Real-Time PCR assays - 12/12/14

Doi : 10.1016/j.mycmed.2014.08.002 
R. Satish Kumar, S. Ramesh
 Department of Microbiology, PRIST University, Thanjavur 614 904, Tamil Nadu, India 

Corresponding author.

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Summary

Candida glabrata is an opportunistic human pathogen known to cause systemic and vaginal candidiasis. Rapid detection of Candida glabrata is indispensable for appropriate selection of antifungal drugs for chemotherapy. The study describes a unique intein-containing DNA fragment for specific detection of Cglabrata. The designed oligonucleotides detected Cglabrata (Ct mean: 24.75±1.1 and Tm: 70.08±0.23°C) in Real-Time PCR assays. The fluorescent signals were negative when the primers were tested for cross-species and cross-genera amplifications. In conclusion, our study recommends a novel primer set for developing a quick identification system which does not require laborious and time-consuming experimentations.

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Résumé

Candida glabrata est un agent pathogène humain opportuniste connu pour causer des candidoses systémiques et vaginales. La détection rapide de Candida glabrata est indispensable pour la sélection appropriée des médicaments antifongiques pour la chimiothérapie. Cette étude décrit un fragment unique d’ADN contenant une intéine pour la détection spécifique de C. glabrata. Les oligonucléotides conçus ont détecté C. glabrata (Ct moyenne : 24,75±1,1 et Tm : 70,08±0,23°C) dans des tests PCR en temps réel. Les signaux fluorescents ont été négatifs lorsque les amorces ont été testées pour des amplifications inter-espèces et inter-genres. En conclusion, notre étude recommande un nouveau jeux d’amorces pour l’élaboration d’un système d’identification rapide qui ne nécessite pas d’expérimentations laborieuses et chronophages.

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Keywords : C. glabrata, Intein, Real-Time PCR, Rapid detection

Mots clés : C. glabrata, Intéine, PCR en temps réel, Détection rapide


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Vol 24 - N° 4

P. 337-340 - décembre 2014 Regresar al número
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