Le traitement de l'infection à Helicobacter pylori (H. pylori) est recommandé chez les enfants souffrant d'ulcère gastroduodénal. Chez l'enfant, la stratégie test-and-treat n'est pas recommandée. Lorsqu'une endoscopie est nécessaire devant un syndrome dyspeptique, et que la présence de H. pylori a été identifiée, un traitement doit être envisagé même en l'absence d'ulcère. En revanche, le traitement doit être absolument proposé aux enfants infectés par H. pylori dont un membre de la famille au premier degré souffre de cancer gastrique. Si certains facteurs liés à l'hôte ou à la bactérie expliquent en partie les échecs des traitements d'éradication de l'infection à H. pylori, l'augmentation mondiale des taux de résistance à la clarithromycine et au métronidazole est le déterminant clé de ces échecs. Les sociétés savantes recommandent d'adapter le traitement soit aux données de l'antibiogramme, soit à celles de la polymerase chain reaction (PCR), puisqu'une endoscopie aura été faite en première intention, et des biopsies prélevées. La durée du traitement est de dix à 14 jours. L'éradication de l'infection doit être contrôlée par un test non invasif dans un délai de quatre à huit semaines après l'arrêt du traitement.